Person: HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK
Loading...
Email Address
Birth Date
Research Projects
Organizational Units
Job Title
Last Name
HASDEMİR GÖKBOĞA
First Name
MÜNEVVER UFUK
Name
34 results
Search Results
Now showing 1 - 10 of 34
Publication Metadata only Performance of RESIST-3 OKN K-SeT immunochromatographic assay for the detection of OXA-48 like, KPC, and NDM carbapenemases in Klebsiella pneumoniae in Turkey(SPRINGER, 2018) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; Sagiroglu, Pinar; Hasdemir, Ufuk; Gelmez, Gulsen Altinkanat; Aksu, Burak; Karatuna, Onur; Soyletir, GunerIn this study, the performance of the RESIST-3 O.K.N. K-SeT (Cofis BioConcept, Gembloux, Belgium) immunochromatographic assay was evaluated in 132 Klebsiella pneumoniae comprising 102 carbapenem resistant and 30 carbapenem susceptible isolates. Genotypically known isolates of Gram negative bacteria (n = 22) including various species were also tested by the assay as controls. The isolates tested by the immunochromatographic assay and also were run PCR for bla(KPC), bla(VIM) bla(NDM), and bla(OXA-48). The rates of bla(NDM), bla(OXA-48), and bla(KPC) in carbapenem resistant isolates were found at 52.9%, 39.2%, and 2.0%, respectively. Both bla(NDM) and bla(OXA-48) were found in six (5.9%) isolates. The results of the assay showed 100% concordance with those obtained by PCR in 132 K. pneumoniae. The agreement between the two methods was found to be identical at the isolate level. The assay also correctly detected all genotypically known isolates of Escherichia coli, Serratia marcescens, Citrobacter freundii, Enterobacter cloacae, K. pneumoniae carrying bla(KPC), bla(NDM), and/or bla(OXA-48). On the other hand, the assay did not exhibit any cross-reaction in control isolates harboring bla(IMP) and bla(VIM). We conclude that the RESIST-3 O.K.N. K-SeT is a reliable, rapid, and user friendly test and we recommend it for routine diagnostic laboratories. (C) 2018 Sociedade Brasileira de Microbiologia. Published by Elsevier Editora Ltda.Publication Metadata only Antibiyotik direncine genomik yaklaşım(2022-11-16) HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; HASDEMİR GÖKBOĞA M. U.Publication Open Access Catalase-negative Staphylococcus aureus: a rare isolate of human infection(BLACKWELL SCIENCE LTD, 2000-12) HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; Over, U; Tuc, Y; Soyletir, GPublication Metadata only Sağlık Cçalışanlarında kantitatif SARS-CoV-2 Anti-Spike antikorlarının zaman Iiçinde yatay Iizlemi ve temsili nötralizasyon testi sonuçları ile korelasyonunun değerlendirilmesi(2022-12-01) HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; TOK Y., Sarinoğlu R., Ördekçi S., YILMAZ Ş., ÖZÇOLPAN G., BAYRAM A., NOHUT O. K., KOÇER İ., HASDEMİR GÖKBOĞA M. U., KUŞKUCU M. A., et al.Publication Metadata only Escherichia coli, klebsiella pneumoniae ve Staphylococcus aureus izolatlarında iki yıllık kümülatif antibiyogram sonuçları(2022-11-16) GÜNEŞER, DENİZ; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; ÜLGER, NURVER; KÜÇÜKSU, UĞUR; İLKİ, ZEYNEP ARZU; Güneşer D., Hasdemir Gökboğa M. U., Ülger N., İlki Z. A., Küçüksu U., Ergan B., Akıllı F. M., Sarı ., Demirkol Ö., Demircan S.Giriş ve Amaç: Kümülatif antibiyotik duyarlılık test verileri, bir hastanede belirli bir zaman periyodunda enfeksiyon etkeni bakterilerin tür bazında duyarlılık sonuçlarının incelenmesine imkan sağlayarak o kurumda doğru ampirik tedavi yaklaşımlarının yönlendirilmesinde kilit rol oynamaktadır. Biz burada hastanemizde iki yıllık dönemde Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae ve Staphylococcus aureus izolatlarının kümülatif antibiyotik duyarlılık test verilerinin analizini sunuyoruz. Gereç ve Yöntem: Ocak 2020 – Aralık 2021’i kapsayan iki yıllık dönemde hastanemizde erişkin hastalarda enfeksiyon etkeni olduğu belirlenen E. coli, K. pneumoniae, S. aureus izolatlarının yıllık bazda kümülatif antibiyotik test sonuçlarını değerlendirdik. Bu değerlendirmeyi KLİMUD Antibiyotik Duyarlılıklarının Saptanması ve İzlenmesi Çalışma Grubu’nun “Antibiyotik Duyarlılık Verilerinin Analizi Ve Sunumu Rehberi” önerileri doğrultusunda yaptık. Değerlendirmeye, TMC Antibiyotik Duyarlılık Testlerinin Standardizasyonu Çalışma Grubu’nun bakteri türü bazında önerdiği antibiyotikler alındı. Escherichia coli ve K. pneumoniae için değerlendirme idrar ve idrar dışı örnekler (kan, solunum, BOS) bazında, S. aureus için metisilin duyarlılığı bazında yapıldı. Laboratuvarımızda rutin olarak idrar Escherichia coli izolatlarında fosfomisin duyarlılığı disk difüzyon ile, S. aureus’ta metisilin duyarlılığı sefoksitin disk difüzyon ile ve indüklenebilir klindamisin direnci D-test ile belirlenmektedir. İzolatların diğer antibiyotiklere duyarlılıkları ise rutin olarak VITEK2 Compact (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ile saptanmaktadır. Antibiyotik duyarlılık testlerinin kalite kontrolü laboratuvarımızda rutin olarak haftalık bazda çalışılmaktadır Bulgular ve Sonuç: İki yıllık dönemde, toplam olarak 2958 E. coli, 1690 K. pneumoniae ve 1087 S. aureus kümülatif antibiyograma dahil edildi. Yıllık bazda izolat sayıları Grafik 1, Grafik 2 ve Grafik 3’te gösterilmektedir. Escherichia coli’nin her iki yılda karbapenem, aminoglikozit, fosfomisin ve nitrofurantoin duyarlılıkları %80’in üzerinde saptandı (Grafik 1). Klebsiella pneumoniae’da, idrar dışı izolatların test edilen antibiyotiklere duyarlılıkları idrar izolatlarına kıyasla belirgin olarak düşük saptandı (Grafik 2). 2020 ile 2021 yılları arasında, birkaç antibiyotik dışında (idrar dışı izolatların kinolon ve trimetoprim/sulfametoksazol duyarlılığı) K. pneumoniae izolatlarının duyarlılık yüzdelerinde belirgin bir fark gözlenmedi. Metisilin dirençli S. aureus’ta (MRSA) makrolid, linkozamid ve tetrasiklin duyarlılıkları, metisiline duyarlı S. aureus (MSSA) izolatlarından belirgin olarak düşük bulundu (Grafik 3). Trimetoprim/ sulfametoksazol ve gentamisin duyarlılıkları açısından, MRSA ve MSSA izolatları açısından belirgin bir fark saptanmadı. Beklenildiği üzere, glikopeptit direnci hiçbir izolatta saptanmadı. Sadece bir izolatta saptanan linezolid direnci doğrulandı. Pandemi döneminPublication Metadata only Genişletilmiş spektrumlu beta-laktamaz enzimini üreten enterobacterales izolatlarına yönelik hızlı tanı kitinin geliştirilmesi(2023-05-25) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; AKSU, MEHMET BURAK; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; Budak B., Can E., Oral D., Öz Ö. B., Sağlam Y., Altınkanat Gelmez G., Aksu M. B., Hasdemir Gökboğa M. U.Giriş ve Amaç: Antibiyotik direnci günümüzün önemli bir sağlık problemi olup, gram negatif bakterilerde genişletilmiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) enzimi üretimi, etkin tedaviyi engelleyen önemli bir direnç mekanizmasıdır. Klinikte yaygın olarak görülen GSBL enzimleri; CTX-M, SHV ve TEM gruplarıdır. Enfeksiyon etkeni bakteride GSBL üretiminin erken saptanması, tedavinin doğru yönlendirilmesi açısından çok önemlidir. Rutin laboratuvarda bu süre en az 24 saati bulmaktadır. Bu çalışmada, gram negatif bakterilerde bu enzimlerin üretimini hızlı saptayacak fenotipik bir test geliştirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Marmara Üniversitesi Pendik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda enfeksiyon etkeni olarak izole edilen 16 Escherichia coli ve 22 Klebsiella pneumoniae çalışmaya dahil edilmiştir. Bakteriler Triton-X (%0,1) ile muamele edilip varsa GSBL enzimlerini açığa çıkartmak üzere hücre çeperleri parçalanmıştır. Bu bakteri süspansiyonları, sefotaksim antibiyotiği (12 mg/mL) ve pH indikatörü olarak fenol kırmızısı (%0,05) içeren tüplere eklenmiştir. GSBL enzimleri varlığında sefotaksim antibiyotiğinin parçalanması ve sonucunda pH’nin asidik yönde değişmesiyle indikatörün renginin kırmızıdan sarı/turuncu’ya dönmesi beklenmiştir. Çalışmanın diğer aşamasında fenotipik testin performansını belirlemek üzere bakterilerde GSBL enzimlerini kodlayan genlerin (blaCTX-M-1, blaCTX-M-2, bla CTX-M-8, bla CTX-M-9, blaSHV-3, blaSHV-18) varlığı altın standart PCR ile araştırılmıştır. Çalışmaya bu enzimleri taşıdığı önceden bilinen kontrol izolatları da dahil edilmiştir. Bulgular: PCR ile 26 izolatta GSBL kodlayan gen saptanırken, 12 izolatta herhangi bir gen saptanmamıştır. Geliştirmeyi hedeflediğimiz fenotipik test, GSBL geni saptanan 26 izolatın hepsinde GSBL enzimini 2 saatte saptamıştır. GSBL geni saptanmayan 12 izolatın hiçbirinde fenotipik testte bu sürede renk değişimi olmamıştır. Sonuç: Testimizin duyarlılığı, özgüllüğü, pozitif prediktif değeri, negatif prediktif değeri %100 olarak bulunmuş olup, bu testin, GSBL üreten mikroorganizmaları 2 saat gibi kısa bir sürede saptamasının, hızla doğru tedavi uygulanmasına ve hasta sağ kalımına çok önemli katkı sağlayacağını düşünüyoruz.Publication Metadata only Yenidoğan yoğun bakımdaki bebeklerin karbapenem dirençli gram(-) bakterilerle kolonizasyonundaki risklerin incelenmesi(2021-10-06) MEMİŞOĞLU, ASLI; ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; KEPENEKLİ KADAYİFCİ, EDA; AY, NADİYE PINAR; BİLGEN, HÜLYA SELVA; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; ÖZEK, EREN; YALÇINOĞLU İ., MEMİŞOĞLU A., ALTINKANAT GELMEZ G., TAVİLOĞLU Z. Ş. , ÖZDEMİR H., KEPENEKLİ KADAYİFCİ E., AY N. P. , BİLGEN H. S. , HASDEMİR M. U. , ÖZEK E.Publication Open Access Detection of a New Resistance-Mediating Plasmid Chimera in a bla(OXA-48)-Positive Klebsiella pneumoniae Strain at a German University Hospital(MDPI, 2021-03-31) HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; Schwanbeck, Julian; Bohne, Wolfgang; Hasdemir, Ufuk; Gross, Uwe; Pfeifer, Yvonne; Bunk, Boyke; Riedel, Thomas; Sproeer, Cathrin; Overmann, Jorg; Frickmann, Hagen; Zautner, Andreas E.Mobile genetic elements, such as plasmids, facilitate the spread of antibiotic resistance genes in Enterobacterales. In line with this, we investigated the plasmid-resistome of seven bla(OXA-48) gene-carrying Klebsiella pneumoniae isolates, which were isolated between 2013 and 2014 at the University Medical Center in Gottingen, Germany. All isolates were subjected to complete genome sequencing including the reconstruction of entire plasmid sequences. In addition, phenotypic resistance testing was conducted. The seven isolates comprised both disease-associated isolates and colonizers isolated from five patients. They fell into two clusters of three sequence type (ST)101 and two ST11 isolates, respectively; and ST15 and ST23 singletons. The seven isolates harbored various plasmids of the incompatibility (Inc) groups IncF, IncL/M, IncN, IncR, and a novel plasmid chimera. All bla(OXA-48) genes were encoded on the IncL/M plasmids. Of note, distinct phenotypical resistance patterns associated with different sets of resistance genes encoded by IncL/M and IncR plasmids were observed among isolates of the ST101 cluster in spite of high phylogenetic relatedness of the bacterial chromosomes, suggesting nosocomial transmission. This highlights the importance of plasmid uptake and plasmid recombination events for the fast generation of resistance variability after clonal transmission. In conclusion, this study contributes a piece in the puzzle of molecular epidemiology of resistance gene-carrying plasmids in K. pneumoniae in Germany.Publication Open Access Performance of “RESIST-3 O.K.N. K-SeT” immunochromatographic assay for the detection of OXA-48 like, KPC, and NDM carbapenemases in Klebsiella pneumoniae in Turkey(2018-10) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; Sağıroğlu, Pınar; Hasdemir, Ufuk; Altınkanat Gelmez, Gülşen; Aksu, Burak; Karatuna, Onur; Söyletir, GünerPublication Metadata only Kandan izole edilen çok ilaca dirençli escherichia coli, klebsiella pneumoniae ve pseudomonas aeruginosa kökenlerinde meropenem-vaborbaktamın etkinliğinin diğer Antibiyotiklerle karşılaştırmalı olarak araştırılması: çok merkezli çalışma(2022-11-16) GÜNEŞER, DENİZ; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; KORTEN, VOLKAN; ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; Altınkanat Gelmez G., Güneşer D., Hasdemir Gökboğa M. U. , Korten V., Sağıroğlu P., Hazırolan G., Gür D., Öktem İ. M. A. , Aygün G.