Person: HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK
Loading...
Email Address
Birth Date
Research Projects
Organizational Units
Job Title
Last Name
HASDEMİR GÖKBOĞA
First Name
MÜNEVVER UFUK
Name
5 results
Search Results
Now showing 1 - 5 of 5
Publication Metadata only Escherichia coli, klebsiella pneumoniae ve Staphylococcus aureus izolatlarında iki yıllık kümülatif antibiyogram sonuçları(2022-11-16) GÜNEŞER, DENİZ; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; ÜLGER, NURVER; KÜÇÜKSU, UĞUR; İLKİ, ZEYNEP ARZU; Güneşer D., Hasdemir Gökboğa M. U., Ülger N., İlki Z. A., Küçüksu U., Ergan B., Akıllı F. M., Sarı ., Demirkol Ö., Demircan S.Giriş ve Amaç: Kümülatif antibiyotik duyarlılık test verileri, bir hastanede belirli bir zaman periyodunda enfeksiyon etkeni bakterilerin tür bazında duyarlılık sonuçlarının incelenmesine imkan sağlayarak o kurumda doğru ampirik tedavi yaklaşımlarının yönlendirilmesinde kilit rol oynamaktadır. Biz burada hastanemizde iki yıllık dönemde Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae ve Staphylococcus aureus izolatlarının kümülatif antibiyotik duyarlılık test verilerinin analizini sunuyoruz. Gereç ve Yöntem: Ocak 2020 – Aralık 2021’i kapsayan iki yıllık dönemde hastanemizde erişkin hastalarda enfeksiyon etkeni olduğu belirlenen E. coli, K. pneumoniae, S. aureus izolatlarının yıllık bazda kümülatif antibiyotik test sonuçlarını değerlendirdik. Bu değerlendirmeyi KLİMUD Antibiyotik Duyarlılıklarının Saptanması ve İzlenmesi Çalışma Grubu’nun “Antibiyotik Duyarlılık Verilerinin Analizi Ve Sunumu Rehberi” önerileri doğrultusunda yaptık. Değerlendirmeye, TMC Antibiyotik Duyarlılık Testlerinin Standardizasyonu Çalışma Grubu’nun bakteri türü bazında önerdiği antibiyotikler alındı. Escherichia coli ve K. pneumoniae için değerlendirme idrar ve idrar dışı örnekler (kan, solunum, BOS) bazında, S. aureus için metisilin duyarlılığı bazında yapıldı. Laboratuvarımızda rutin olarak idrar Escherichia coli izolatlarında fosfomisin duyarlılığı disk difüzyon ile, S. aureus’ta metisilin duyarlılığı sefoksitin disk difüzyon ile ve indüklenebilir klindamisin direnci D-test ile belirlenmektedir. İzolatların diğer antibiyotiklere duyarlılıkları ise rutin olarak VITEK2 Compact (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ile saptanmaktadır. Antibiyotik duyarlılık testlerinin kalite kontrolü laboratuvarımızda rutin olarak haftalık bazda çalışılmaktadır Bulgular ve Sonuç: İki yıllık dönemde, toplam olarak 2958 E. coli, 1690 K. pneumoniae ve 1087 S. aureus kümülatif antibiyograma dahil edildi. Yıllık bazda izolat sayıları Grafik 1, Grafik 2 ve Grafik 3’te gösterilmektedir. Escherichia coli’nin her iki yılda karbapenem, aminoglikozit, fosfomisin ve nitrofurantoin duyarlılıkları %80’in üzerinde saptandı (Grafik 1). Klebsiella pneumoniae’da, idrar dışı izolatların test edilen antibiyotiklere duyarlılıkları idrar izolatlarına kıyasla belirgin olarak düşük saptandı (Grafik 2). 2020 ile 2021 yılları arasında, birkaç antibiyotik dışında (idrar dışı izolatların kinolon ve trimetoprim/sulfametoksazol duyarlılığı) K. pneumoniae izolatlarının duyarlılık yüzdelerinde belirgin bir fark gözlenmedi. Metisilin dirençli S. aureus’ta (MRSA) makrolid, linkozamid ve tetrasiklin duyarlılıkları, metisiline duyarlı S. aureus (MSSA) izolatlarından belirgin olarak düşük bulundu (Grafik 3). Trimetoprim/ sulfametoksazol ve gentamisin duyarlılıkları açısından, MRSA ve MSSA izolatları açısından belirgin bir fark saptanmadı. Beklenildiği üzere, glikopeptit direnci hiçbir izolatta saptanmadı. Sadece bir izolatta saptanan linezolid direnci doğrulandı. Pandemi döneminPublication Metadata only Karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae ve Escherichia coli İzolatlarının Kolistine, Seftazidim-Avibaktama Duyarlılıkları ve Karbapenem Direnç Mekanizmaları(2022-12-01) ÜLGER, NURVER; İLKİ, ZEYNEP ARZU; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; KÜÇÜKSU U., AKILLI F. M., ÜLGER N., İLKİ Z. A., SAYIN E., HASDEMİR GÖKBOĞA M. U.Publication Metadata only Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae ve Staphylococcus aureus İzolatlarında İki Yıllık Kümülatif Antibiyogram Sonuçları(2022-12-01) GÜNEŞER, DENİZ; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; ÜLGER, NURVER; İLKİ, ZEYNEP ARZU; SARI, MELTEM; GÜNEŞER D., HASDEMİR GÖKBOĞA M. U., ÜLGER N., İLKİ Z. A., KÜÇÜKSU U., Ergan B., AKILLI F. M., SARI M., DEMİRKOL Ö., DEMİRCAN S.Publication Metadata only Comparative in vitro activity of plazomicin and older aminoglyosides against Enterobacterales isolates; prevalence of aminoglycoside modifying enzymes and 16S rRNA methyltransferases(ELSEVIER SCIENCE INC, 2020) AKSU, MEHMET BURAK; Gur, Deniz; Hasdemir, Ufuk; Cakar, Asli; Cavusoglu, Iffet; Celik, Tugce; Aksu, Burak; Sancak, Banu; Altun, Belgin; Soyletir, Guner; Ulger, Nurver; Kararuna, Onur; Karahan, Zeynep Ceren; Evren, Ebru; Bakici, Zahir; Celik, Cem; Akpolat, Nezahat; Gulay, Zeynep; Sari, Ayse Nur; Aydemir, Sohret; Cilli, Feriha; Kilic, Huseyin; Parkan, Omiir Mustafa; Zer, Yasemin; Buyuktas, Ayse; Koksal, Fauna; Aydin, Faruk; Ozkaya, Esra; Birinci, Asuman; Cayci, Yeliz Tanriverdi; Tuncer, InciComparative in vitro activity of plazomicin and 4 older aminoglycosides was evaluated with broth microdilution in 714 blood isolates from 14 hospitals in Turkey. Isolates included Escherichia coli (n=320), Klebsiella spp. (n=294), Enterobacter spp. (n =69), Serratia marcescens (n=20). and Citrobacter spp. (n=11). Isolates resistant to older aminoglycosides (n=240) were screened for aminoglycoside modifying enzyme genes: aac(6')-Ib, aac(3)-Ia, aac(3)-IIa, ant(2 '')-Ia. Isolates with high MICs for plazomicin (n=41) were screened for 165 rRNA methyltransferase genes (armA, rmtA, rmtB, rmtC, rmtD, rmtE, rmtF, rmtG, rmtH, npmA) and 2 carbapenemase genes (blaOXA-48, blaNDM-1). Overall, resistance to plazomicin, amikacin, netilmicin, gentamicin, and tobramycin was 7.7%, 7.4%, 31.5%, 32.9%, and 34.7%, respectively. aac(6')-Ib and aac(3)-IIa were the most common AME genes. Co-occurrence of blaNDM-1 with armA and rmtC and blaOXA-48 with armA was striking. Enterobacter cloacae carrying rmtC+blaNDM-1, S. marcescens with armA+blaOXA-48, and rmtF+ blaOXA-48 in K. pneumoniae were reported for the first time. (C) 2020 Elsevier Inc. All rights reserved.Publication Metadata only İnvaziv örneklerden izole edilen klebsiella pneumoniae suşlarında aminoglikozid direncinin araştırılması(2019-03-04) AKSU, MEHMET BURAK; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; ÜLGER, NURVER; Çelik T., Çavuşoğlu İ., Aksu M. B., Hasdemir Gökboğa M. U., Ülger N.Aminoglikozitler, mikroorganizmaların protein sentezini inhibe ederek bakterisidal etki gösteren geniş spektrumlu antibiyotiklerdir. Gram pozitif ve özellikle gram negatif patojenlerin yol açtığı ciddi enfeksiyonların tedavisinde, genellikle beta-laktam grubu antibiyotiklerle kombine edilerek kullanılırlar. Ancak, bakterilerde aminoglikozitlere karşı artan oranda direnç gelişmektedir. Dirence, başta ilacın enzimatik modifikasyonu olmak üzere dış membran geçirgenliğinde azalma, aktif efluks, ribozomal proteinlerde amino asit yer değişimi gibi direnç mekanizmalarından bir veya daha fazlası neden olmaktadır. Bu çalışmada invaziv klinik örneklerden izole edilmiş Klebsiella pneumoniae izolatlarında aminoglikozitlere dirençten sorumlu olabilecek mekanizmaların araştırılmıştır. Marmara Üniversitesi Hastanesi’nde 2016 yılında, 35’i kandan olmak üzere steril vücut sıvılarından izole edilen 38 K.pneumoniae izolatı çalışmaya alınmıştır. Rutin antibiyotik duyarlılık testinde (VİTEK2 Compact, Biomerieux) amikasin ve gentamisinden birine veya ikisine dirençli bulunan izolatlara standart sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle (EUCAST version 1.0), amikasin, gentamisin, tobramisin ve netilmisinin minimum inhibitor konsantrasyonları (MIK) belirlenmiştir. Bu izolatlarda aminoglikozit modifikasyon enzimlerini kodlayan genler, aac(6’)-1, aac(3)-II, aac(3)-I ve ant(2’’)-1, ve yüksek düzey dirençten (≥128 mg/L) sorumlu olabilecek ribozomal metiltransferaz enzimlerini kodlayan armA, rmtA, rmtB, rmtC, rmtD, rmtD, rmtE, rmtF, rmtG, rmtH and npmA genlerinin varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle araştırılmıştır. Elde edilen PCR ürünleri dizi analiziyle (GATC Biotech AG, Konstanz, Germany) doğrulanmıştır. İzolatların 32’si aminoglikozitlerin tamamına duyarlı bulunmuştur. Diğer 6 izolatın 2’si dört aminoglikozite de yüksek düzeyde dirençli (>256 mg/L) bulunmuştur. Bu izolatlarda aynı zamanda ribozomal metiltransferaz enzimini kodlayan rmtC geni saptanmıştır. Dört izolatın ise en az bir aminoglikozite direnç olduğu, aminoglikozit modifikasyon enzimlerini kodlayan aac(6’)-1 (n:1), aac(3)-II(n:1), aac(6’)-1 + aac(3)-II (n:2) genlerini bulundurduğu saptanmıştır. Panik değeri olan klinik materyallerden izole edilen 38 K. pneumoniae izolatlarının 6’sı (%16) aminoglikozitlere dirençli ve bunlardan ikisi tüm aminoglikozitlere yüksek düzeyde dirençli bulunmuş, direncin ribozomal metiltransferaz enzimini kodlayan rmtC geniyle ilişkili olduğu saptanmıştır. Yapılacak benzer çalışmalar, metiltransferazlardan kaynaklanan aminoglikozit direncinin izlenmesi ve bu enzimleri kodlayan genlerin yayılımının önlenmesi bakımından önem taşımaktadır.