Person: HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK
Loading...
Email Address
Birth Date
Research Projects
Organizational Units
Job Title
Last Name
HASDEMİR GÖKBOĞA
First Name
MÜNEVVER UFUK
Name
9 results
Search Results
Now showing 1 - 9 of 9
Publication Metadata only Genişletilmiş spektrumlu beta-laktamaz enzimini üreten enterobacterales izolatlarına yönelik hızlı tanı kitinin geliştirilmesi(2023-05-25) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; AKSU, MEHMET BURAK; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; Budak B., Can E., Oral D., Öz Ö. B., Sağlam Y., Altınkanat Gelmez G., Aksu M. B., Hasdemir Gökboğa M. U.Giriş ve Amaç: Antibiyotik direnci günümüzün önemli bir sağlık problemi olup, gram negatif bakterilerde genişletilmiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) enzimi üretimi, etkin tedaviyi engelleyen önemli bir direnç mekanizmasıdır. Klinikte yaygın olarak görülen GSBL enzimleri; CTX-M, SHV ve TEM gruplarıdır. Enfeksiyon etkeni bakteride GSBL üretiminin erken saptanması, tedavinin doğru yönlendirilmesi açısından çok önemlidir. Rutin laboratuvarda bu süre en az 24 saati bulmaktadır. Bu çalışmada, gram negatif bakterilerde bu enzimlerin üretimini hızlı saptayacak fenotipik bir test geliştirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Marmara Üniversitesi Pendik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda enfeksiyon etkeni olarak izole edilen 16 Escherichia coli ve 22 Klebsiella pneumoniae çalışmaya dahil edilmiştir. Bakteriler Triton-X (%0,1) ile muamele edilip varsa GSBL enzimlerini açığa çıkartmak üzere hücre çeperleri parçalanmıştır. Bu bakteri süspansiyonları, sefotaksim antibiyotiği (12 mg/mL) ve pH indikatörü olarak fenol kırmızısı (%0,05) içeren tüplere eklenmiştir. GSBL enzimleri varlığında sefotaksim antibiyotiğinin parçalanması ve sonucunda pH’nin asidik yönde değişmesiyle indikatörün renginin kırmızıdan sarı/turuncu’ya dönmesi beklenmiştir. Çalışmanın diğer aşamasında fenotipik testin performansını belirlemek üzere bakterilerde GSBL enzimlerini kodlayan genlerin (blaCTX-M-1, blaCTX-M-2, bla CTX-M-8, bla CTX-M-9, blaSHV-3, blaSHV-18) varlığı altın standart PCR ile araştırılmıştır. Çalışmaya bu enzimleri taşıdığı önceden bilinen kontrol izolatları da dahil edilmiştir. Bulgular: PCR ile 26 izolatta GSBL kodlayan gen saptanırken, 12 izolatta herhangi bir gen saptanmamıştır. Geliştirmeyi hedeflediğimiz fenotipik test, GSBL geni saptanan 26 izolatın hepsinde GSBL enzimini 2 saatte saptamıştır. GSBL geni saptanmayan 12 izolatın hiçbirinde fenotipik testte bu sürede renk değişimi olmamıştır. Sonuç: Testimizin duyarlılığı, özgüllüğü, pozitif prediktif değeri, negatif prediktif değeri %100 olarak bulunmuş olup, bu testin, GSBL üreten mikroorganizmaları 2 saat gibi kısa bir sürede saptamasının, hızla doğru tedavi uygulanmasına ve hasta sağ kalımına çok önemli katkı sağlayacağını düşünüyoruz.Publication Metadata only Yenidoğan yoğun bakımdaki bebeklerin karbapenem dirençli gram(-) bakterilerle kolonizasyonundaki risklerin incelenmesi(2021-10-06) MEMİŞOĞLU, ASLI; ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; KEPENEKLİ KADAYİFCİ, EDA; AY, NADİYE PINAR; BİLGEN, HÜLYA SELVA; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; ÖZEK, EREN; YALÇINOĞLU İ., MEMİŞOĞLU A., ALTINKANAT GELMEZ G., TAVİLOĞLU Z. Ş. , ÖZDEMİR H., KEPENEKLİ KADAYİFCİ E., AY N. P. , BİLGEN H. S. , HASDEMİR M. U. , ÖZEK E.Publication Metadata only Kandan izole edilen çok ilaca dirençli escherichia coli, klebsiella pneumoniae ve pseudomonas aeruginosa kökenlerinde meropenem-vaborbaktamın etkinliğinin diğer Antibiyotiklerle karşılaştırmalı olarak araştırılması: çok merkezli çalışma(2022-11-16) GÜNEŞER, DENİZ; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; KORTEN, VOLKAN; ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; Altınkanat Gelmez G., Güneşer D., Hasdemir Gökboğa M. U. , Korten V., Sağıroğlu P., Hazırolan G., Gür D., Öktem İ. M. A. , Aygün G.Publication Metadata only Evaluation of two commercial methods for rapid detection of the carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae(ELSEVIER, 2020) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; Gelmez, Gulsen Altinkanat; Can, Baris; Hasdemir, Ufuk; Soyletir, GunerIn this study, we evaluated the performance of the two commercial methods (Rapidec Carba NP and NG-Test Carba-5) for the rapid detection of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae. A total of 224 Klebsiella pneumoniae strains previously characterized for carbapenemase genes by polymerase chain reaction were included in the study. The strain collection included 30 non-carbapenemase producers, 85 OXA-48-like, 59 NDM, 14 IMP, 7 KPC, 7 VIM, 19 OXA-48-like plus NDM, and 3 KPC plus NDM producers. Rapidec Carba NP and NG-Test Carba 5 was performed according to the manufacturer's instructions. NG-Test Carba 5 correctly detected all carbapenemase-producing K. pneumoniae, however, Rapidec Carba NP failed to detect 41% of OXA-48-like producers even with extended incubation time. The overall sensitivity and specificity were 81,9% and 100% for Rapidec Carba NP, 100% and 100% for NG-Test Carba 5, respectively. Both tests seem to be fast and reliable for the detection of carbapenemase-producing K. pneumoniae especially for microbiology laboratories where molecular tests cannot be performed. However, Rapidec Carba NP with weak hydrolysis activity for OXA-48 like might be used in regions where OXA-48 is not prevalent. The additional advantage of NG-Test Carba 5 is that it specifically detects carbapenemases giving way to threat-related infections with an effective drug such as ceftazidime-avibactam or meropenem- vaborbactam.Publication Metadata only Evaluation of phenotypic tests for detection of carbapenemases: New modifications with new interpretation(ELSEVIER, 2021) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; Gelmez, Gulsen Altinkanat; Can, Baris; Hasdemir, Ufuk; Soyletir, GunerIntroduction: The emergence and spread of carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) is a worldwide public health threat. Rapid and accurate detection of CPE is essential to prevent their dissemination within health care settings. The aim of this study was to evaluate the performance of CIM, mCIM and mCIM with ammonium bicarbonate (mCIM-A) methods by using different interpretation criteria for detection of carbapenemases. Methods: One hundred and fifty-three Klebsiella pneumoniae isolates previously characterized by molecular tests, including 133 carbapenemase producers and 20 non-carbapenemase producers, were collected in this study. CIM and mCIM tests were performed as described previously. mCIM-A by adding 50 mM ammonium bicarbonate to the bacterial suspension prepared in tryptic soy broth. The inhibition zone diameter of around meropenem disc was measured and interpreted as positive according to i) Pierce and colleagues (<19 mm), ii) EUCAST meropenem susceptibility breakpoint (<22). Results: CIM, although seems to be good for carbapenemases other than OXA-48-like and NDM, is not satisfactory (42.3% and 83.4%, respectively) for those enzymes with any of the interpretation criteria. OXA-48-like and NDM were detected with a better performance (88.7% and 92.8, respectively) with mCIM when results were interpreted according to <22 mm zone diameter for OXA-48-like and NDM. The best results were obtained with mCIM-A using <22 mm criteria without any difference in the results of other enzymes and negative strains. Conclusions: mCIM- A method interpreted with <22 mm meropenem zone diameter seems to be preferable compared to CIM and mCIM. mCIM-A is simple and useful tool for identification of CPEs in clinical microbiology laboratories. (C) 2020 Japanese Society of Chemotherapy and The Japanese Association for Infectious Diseases. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.Publication Open Access Enterobacterales Üyelerinde Nadir Bir Plazmid _x000D_ Aracılı A Sınıfı Beta Laktamaz Olan IBC-1'in _x000D_ Araştırılması(2021-08-25) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; Gülşen GELEMEZ;Ufuk HASDEMİR;Güner SÖYLETİRAmaç: Bu çalışmanın amacı, tüm dünyada sıklıkla gözlemlenen geniş spektrumlu beta laktamazları (GSBL) TEM, SHV ve CTX-M ve nadir görülen IBC-1 beta laktamaz enziminin varlığını araştırmaktır. Gereç ve Yöntem: Marmara Üniversitesi Hastanesinde yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen, fenotipik olarak GSBL üreten ve IBC-1 fenotipi gösteren 30 köken çalışmaya dahil edilmiştir. Antibiyotik duyarlılık testleri disk difüzyon ve agarda dilüsyon yöntemi ile gerçekleştirilmiştir. GSBL enzimlerinin fenotipik olarak saptanmasında E-test ve çift disk sinerji yöntemi kullanılmıştır. GSBL üretiminden sorumlu olan genlerinin varlığını saptamak amacıyla polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yapılmıştır.Bulgular: Kökenlerin tamamı, imipeneme duyarlı bulunurken, ampisilin, amoksisilin klavulanik asit, piperasilin, seftazidim ve trimetoprim sülfametaksazole dirençli olarak; saptanmıştır. E-test yöntemiyle 4 köken tanımsız, 26 köken ise GSBL pozitif saptanmıştır. Çift disk sinerji yöntemi ile 2 köken fenotipik olarak IBC-1 pozitif iken, 5 köken şüpheli pozitif olarak belirlenmiştir. Kökenlerimizin blaTEM, blaSHV ve blaCTX-M genlerini taşıma oranı sırasıyla %73,3, %60 ve %56,6 olarak belirlenmiştir. blaIBC geni ise hiçbir kökende saptanmamıştır. Sonuç: İlk olarak Yunanistan’da saptanan IBC-1 enzimi ülkemiz için henüz bir tehlike oluşturmazken GSBL pozitif kökenlerde TEM, SHV ve CTX-M enzimlerinin oranı oldukça yüksek olarak tespit edilmiştir.Publication Metadata only Karbapenem dirençli klebsiella pneumoniae kökenlerinde kolistin duyarlılığının belirlenmesinde kolistin sıvı disk elüsyon yönteminin performansının değerlendirilmesi(2022-05-27) KÜÇÜKSU, UĞUR; ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; Aghabalapoor Keshtiban E., Güner O. E. , Özgen B., Seyyedsayyah M., Küçüksu U., Altınkanat Gelmez G., Hasdemir Gökboğa M. U.Publication Metadata only Hastanemizde klinik örneklerden İzole edilen karbapenem dirençli klebsiella pneumoniae suşlarındaki fosfomisin direnç durumlarının araştırılması(2022-12-01) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; KÜÇÜKSU U., ALTINKANAT GELMEZ G., HASDEMİR GÖKBOĞA M. U.Publication Metadata only Kandan İzole Edilen Çok İlaca Dirençli Escherichia Coli, Klebsiella Pneumoniae ve Pseudomonas Aeruginosa Kökenlerinde Meropenem-Vaborbaktamın Etkinliğinin Diğer Antibiyotiklerle Karşılaştırmalı Olarak Araştırılması: Çok Merkezli Çalışma(2022-12-01) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; GÜNEŞER, DENİZ; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; KORTEN, VOLKAN; ALTINKANAT GELMEZ G., GÜNEŞER D., HASDEMİR GÖKBOĞA M. U., KORTEN V., SAĞIROĞLU P., HAZIROLAN G., GÜR D., ÖKTEM İ. M. A., AYGÜN G.