Person:
HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK

Profile Picture

Email Address

Birth Date

Research Projects

Organizational Units

OrgUnit Logo
Organizational Unit

Job Title

Last Name

HASDEMİR GÖKBOĞA

First Name

MÜNEVVER UFUK

Name

Filters

Reset filters

Settings

Start date: 2000 × Has files: false ×

Search Results

Now showing 1 - 10 of 24
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Performance of RESIST-3 OKN K-SeT immunochromatographic assay for the detection of OXA-48 like, KPC, and NDM carbapenemases in Klebsiella pneumoniae in Turkey
    (SPRINGER, 2018) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; Sagiroglu, Pinar; Hasdemir, Ufuk; Gelmez, Gulsen Altinkanat; Aksu, Burak; Karatuna, Onur; Soyletir, Guner
    In this study, the performance of the RESIST-3 O.K.N. K-SeT (Cofis BioConcept, Gembloux, Belgium) immunochromatographic assay was evaluated in 132 Klebsiella pneumoniae comprising 102 carbapenem resistant and 30 carbapenem susceptible isolates. Genotypically known isolates of Gram negative bacteria (n = 22) including various species were also tested by the assay as controls. The isolates tested by the immunochromatographic assay and also were run PCR for bla(KPC), bla(VIM) bla(NDM), and bla(OXA-48). The rates of bla(NDM), bla(OXA-48), and bla(KPC) in carbapenem resistant isolates were found at 52.9%, 39.2%, and 2.0%, respectively. Both bla(NDM) and bla(OXA-48) were found in six (5.9%) isolates. The results of the assay showed 100% concordance with those obtained by PCR in 132 K. pneumoniae. The agreement between the two methods was found to be identical at the isolate level. The assay also correctly detected all genotypically known isolates of Escherichia coli, Serratia marcescens, Citrobacter freundii, Enterobacter cloacae, K. pneumoniae carrying bla(KPC), bla(NDM), and/or bla(OXA-48). On the other hand, the assay did not exhibit any cross-reaction in control isolates harboring bla(IMP) and bla(VIM). We conclude that the RESIST-3 O.K.N. K-SeT is a reliable, rapid, and user friendly test and we recommend it for routine diagnostic laboratories. (C) 2018 Sociedade Brasileira de Microbiologia. Published by Elsevier Editora Ltda.
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Antibiyotik direncine genomik yaklaşım
    (2022-11-16) HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; HASDEMİR GÖKBOĞA M. U.
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Sağlık Cçalışanlarında kantitatif SARS-CoV-2 Anti-Spike antikorlarının zaman Iiçinde yatay Iizlemi ve temsili nötralizasyon testi sonuçları ile korelasyonunun değerlendirilmesi
    (2022-12-01) HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; TOK Y., Sarinoğlu R., Ördekçi S., YILMAZ Ş., ÖZÇOLPAN G., BAYRAM A., NOHUT O. K., KOÇER İ., HASDEMİR GÖKBOĞA M. U., KUŞKUCU M. A., et al.
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Escherichia coli, klebsiella pneumoniae ve Staphylococcus aureus izolatlarında iki yıllık kümülatif antibiyogram sonuçları
    (2022-11-16) GÜNEŞER, DENİZ; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; ÜLGER, NURVER; KÜÇÜKSU, UĞUR; İLKİ, ZEYNEP ARZU; Güneşer D., Hasdemir Gökboğa M. U., Ülger N., İlki Z. A., Küçüksu U., Ergan B., Akıllı F. M., Sarı ., Demirkol Ö., Demircan S.
    Giriş ve Amaç: Kümülatif antibiyotik duyarlılık test verileri, bir hastanede belirli bir zaman periyodunda enfeksiyon etkeni bakterilerin tür bazında duyarlılık sonuçlarının incelenmesine imkan sağlayarak o kurumda doğru ampirik tedavi yaklaşımlarının yönlendirilmesinde kilit rol oynamaktadır. Biz burada hastanemizde iki yıllık dönemde Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae ve Staphylococcus aureus izolatlarının kümülatif antibiyotik duyarlılık test verilerinin analizini sunuyoruz. Gereç ve Yöntem: Ocak 2020 – Aralık 2021’i kapsayan iki yıllık dönemde hastanemizde erişkin hastalarda enfeksiyon etkeni olduğu belirlenen E. coli, K. pneumoniae, S. aureus izolatlarının yıllık bazda kümülatif antibiyotik test sonuçlarını değerlendirdik. Bu değerlendirmeyi KLİMUD Antibiyotik Duyarlılıklarının Saptanması ve İzlenmesi Çalışma Grubu’nun “Antibiyotik Duyarlılık Verilerinin Analizi Ve Sunumu Rehberi” önerileri doğrultusunda yaptık. Değerlendirmeye, TMC Antibiyotik Duyarlılık Testlerinin Standardizasyonu Çalışma Grubu’nun bakteri türü bazında önerdiği antibiyotikler alındı. Escherichia coli ve K. pneumoniae için değerlendirme idrar ve idrar dışı örnekler (kan, solunum, BOS) bazında, S. aureus için metisilin duyarlılığı bazında yapıldı. Laboratuvarımızda rutin olarak idrar Escherichia coli izolatlarında fosfomisin duyarlılığı disk difüzyon ile, S. aureus’ta metisilin duyarlılığı sefoksitin disk difüzyon ile ve indüklenebilir klindamisin direnci D-test ile belirlenmektedir. İzolatların diğer antibiyotiklere duyarlılıkları ise rutin olarak VITEK2 Compact (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ile saptanmaktadır. Antibiyotik duyarlılık testlerinin kalite kontrolü laboratuvarımızda rutin olarak haftalık bazda çalışılmaktadır Bulgular ve Sonuç: İki yıllık dönemde, toplam olarak 2958 E. coli, 1690 K. pneumoniae ve 1087 S. aureus kümülatif antibiyograma dahil edildi. Yıllık bazda izolat sayıları Grafik 1, Grafik 2 ve Grafik 3’te gösterilmektedir. Escherichia coli’nin her iki yılda karbapenem, aminoglikozit, fosfomisin ve nitrofurantoin duyarlılıkları %80’in üzerinde saptandı (Grafik 1). Klebsiella pneumoniae’da, idrar dışı izolatların test edilen antibiyotiklere duyarlılıkları idrar izolatlarına kıyasla belirgin olarak düşük saptandı (Grafik 2). 2020 ile 2021 yılları arasında, birkaç antibiyotik dışında (idrar dışı izolatların kinolon ve trimetoprim/sulfametoksazol duyarlılığı) K. pneumoniae izolatlarının duyarlılık yüzdelerinde belirgin bir fark gözlenmedi. Metisilin dirençli S. aureus’ta (MRSA) makrolid, linkozamid ve tetrasiklin duyarlılıkları, metisiline duyarlı S. aureus (MSSA) izolatlarından belirgin olarak düşük bulundu (Grafik 3). Trimetoprim/ sulfametoksazol ve gentamisin duyarlılıkları açısından, MRSA ve MSSA izolatları açısından belirgin bir fark saptanmadı. Beklenildiği üzere, glikopeptit direnci hiçbir izolatta saptanmadı. Sadece bir izolatta saptanan linezolid direnci doğrulandı. Pandemi dönemin
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Genişletilmiş spektrumlu beta-laktamaz enzimini üreten enterobacterales izolatlarına yönelik hızlı tanı kitinin geliştirilmesi
    (2023-05-25) ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; AKSU, MEHMET BURAK; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; Budak B., Can E., Oral D., Öz Ö. B., Sağlam Y., Altınkanat Gelmez G., Aksu M. B., Hasdemir Gökboğa M. U.
    Giriş ve Amaç: Antibiyotik direnci günümüzün önemli bir sağlık problemi olup, gram negatif bakterilerde genişletilmiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) enzimi üretimi, etkin tedaviyi engelleyen önemli bir direnç mekanizmasıdır. Klinikte yaygın olarak görülen GSBL enzimleri; CTX-M, SHV ve TEM gruplarıdır. Enfeksiyon etkeni bakteride GSBL üretiminin erken saptanması, tedavinin doğru yönlendirilmesi açısından çok önemlidir. Rutin laboratuvarda bu süre en az 24 saati bulmaktadır. Bu çalışmada, gram negatif bakterilerde bu enzimlerin üretimini hızlı saptayacak fenotipik bir test geliştirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Marmara Üniversitesi Pendik Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda enfeksiyon etkeni olarak izole edilen 16 Escherichia coli ve 22 Klebsiella pneumoniae çalışmaya dahil edilmiştir. Bakteriler Triton-X (%0,1) ile muamele edilip varsa GSBL enzimlerini açığa çıkartmak üzere hücre çeperleri parçalanmıştır. Bu bakteri süspansiyonları, sefotaksim antibiyotiği (12 mg/mL) ve pH indikatörü olarak fenol kırmızısı (%0,05) içeren tüplere eklenmiştir. GSBL enzimleri varlığında sefotaksim antibiyotiğinin parçalanması ve sonucunda pH’nin asidik yönde değişmesiyle indikatörün renginin kırmızıdan sarı/turuncu’ya dönmesi beklenmiştir. Çalışmanın diğer aşamasında fenotipik testin performansını belirlemek üzere bakterilerde GSBL enzimlerini kodlayan genlerin (blaCTX-M-1, blaCTX-M-2, bla CTX-M-8, bla CTX-M-9, blaSHV-3, blaSHV-18) varlığı altın standart PCR ile araştırılmıştır. Çalışmaya bu enzimleri taşıdığı önceden bilinen kontrol izolatları da dahil edilmiştir. Bulgular: PCR ile 26 izolatta GSBL kodlayan gen saptanırken, 12 izolatta herhangi bir gen saptanmamıştır. Geliştirmeyi hedeflediğimiz fenotipik test, GSBL geni saptanan 26 izolatın hepsinde GSBL enzimini 2 saatte saptamıştır. GSBL geni saptanmayan 12 izolatın hiçbirinde fenotipik testte bu sürede renk değişimi olmamıştır. Sonuç: Testimizin duyarlılığı, özgüllüğü, pozitif prediktif değeri, negatif prediktif değeri %100 olarak bulunmuş olup, bu testin, GSBL üreten mikroorganizmaları 2 saat gibi kısa bir sürede saptamasının, hızla doğru tedavi uygulanmasına ve hasta sağ kalımına çok önemli katkı sağlayacağını düşünüyoruz.
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Yenidoğan yoğun bakımdaki bebeklerin karbapenem dirençli gram(-) bakterilerle kolonizasyonundaki risklerin incelenmesi
    (2021-10-06) MEMİŞOĞLU, ASLI; ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; KEPENEKLİ KADAYİFCİ, EDA; AY, NADİYE PINAR; BİLGEN, HÜLYA SELVA; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; ÖZEK, EREN; YALÇINOĞLU İ., MEMİŞOĞLU A., ALTINKANAT GELMEZ G., TAVİLOĞLU Z. Ş. , ÖZDEMİR H., KEPENEKLİ KADAYİFCİ E., AY N. P. , BİLGEN H. S. , HASDEMİR M. U. , ÖZEK E.
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Kandan izole edilen çok ilaca dirençli escherichia coli, klebsiella pneumoniae ve pseudomonas aeruginosa kökenlerinde meropenem-vaborbaktamın etkinliğinin diğer Antibiyotiklerle karşılaştırmalı olarak araştırılması: çok merkezli çalışma
    (2022-11-16) GÜNEŞER, DENİZ; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; KORTEN, VOLKAN; ALTINKANAT GELMEZ, GÜLŞEN; Altınkanat Gelmez G., Güneşer D., Hasdemir Gökboğa M. U. , Korten V., Sağıroğlu P., Hazırolan G., Gür D., Öktem İ. M. A. , Aygün G.
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Simple and reliable detection of slime production of Candida spp. directly from blood culture bottles: Comparison of visual tube method and transmission electron microscopy
    (SPRINGER, 2004) HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; Cerikcioglu, N; Hasdemir, UO; San, T; Salik, E; Soyletir, G
    Early detection of slime production may be useful for clinical decision because of its suggestive property for potential pathogenic capacity of a Candida strain especially in patients with a prosthetic device. In this study we aimed to compare the visual tube method (VTM) with transmission electron microscopy (TEM) in order to confirm the reliability of the former method. In order to demonstrate the reproducibility of the tube method and to determine the correct timing for the test, Candida isolates directly obtained from blood culture (DBC) bottles and their two subsequent subcultures were used. The results of this study showed that VTM is a simple and reliable method which can be used in every clinical mycology laboratory, provided that the test is applied on DBC isolates; as the ability of slime production is decreased or lost even after the first subculturing. We suggest that this simple method can be used and may have some contributions to the ongoing studies on the controversial issue concerning removal of biomaterials in candidemic patients.
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Investigation of Carbapenemases in Carbapenem-Resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae Strains Isolated in 2014 in Turkey
    (ANKARA MICROBIOLOGY SOC, 2016) HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; Cakar, Asli; Akyon, Yakut; Gur, Deniz; Karatuna, Onur; Ogunc, Dilara; Baysan, Betil Ozhak; Coplu, Nilay; Cagatay, Mustafa; Kilic, Abdullah; Baysallar, Mehmet; Bakici, Zahir; Celik, Cem; Gulay, Zeynep; Aydemir, Sohret; Tunger, Alper; Kilic, Huseyin; Ercal, Baris Derya; Toraman, Zulal Asci; Zer, Yasemin; Buyuktas, Ayse; Ay, Selma; Aktas, Zerrin; Kayacan, Cigdem; Bayramoglu, Gulcin; Aydin, Faruk; Dundar, Devrim; Hasdemir, Ufuk; Ayas, Ramazan; Yanik, Keramettin; Gunaydin, Murat; Guducuoglu, Huseyin; Parlak, Mehmet
    Carbapenems are the choice of treatment in infections caused by multidrug resistant Enterobacteriaceae. In recent years carbapenem-resistant Enterobacteriaceae isolates due to carbapenemases have been increasingly reported worldwide. Multicenter studies on carbapenemases are scarce in Turkey. The aim of this study was to determine the distribution of carbapenemases from different parts of Turkey as a part of the European Survey of Carbapenemase Producing Enterobacteriaceae (EuSCAPE) project. Beginning in November 2013, carbapenem-resistant isolates resistant to at least one of the agents, namely imipenem, meropenem, and ertapenem were sent to the coordinating center. Minimum inhibitory concentrations for these carbapenems were determined by microdilution tests following EUCAST guidelines. Production of carbapenemase was confirmed by combination disk synergy tests. Types of carbapenemases were investigated using specific primers for VIM, IMP; NDM, KPC and OXA-48 genes by multiplex polymerase chain reaction. In a six month period, 155 suspected carbapenemase-positive isolates were sent to the coordinating center of which 21 (13.5%) were E.coli and 134 (86.5%) were K.pneumoniae. Nineteen (90.5%) strains among E.coli and 124 (92.5%) strains among K.pneumoniae were shown to harbour at least one carbapenemase gene by molecular tests, with a total of 92.3% (143/155). Carbapenemases were determined as a single enzyme in 136 strains (OXA-48: 84.6%; NDM: 6.3%; VIM: 2.8%; IMP: 1.4%) and as a combination in seven isolates (OXA-48 + NDM: 2.1%; OXA-48 + VIM: 2.1%; VIM + NDM: 0.7%). KPC was not detected in any of the isolates. According to the microdilution test results, resistance to imipenem, meropenem and ertapenem in OXA-48 isolates were 59.5%, 52.9% and 100%, respectively. The combination disk synergy test was 100% compatible with the molecular test results. As most of the OXA-48 producing isolates were susceptible to meropenem but all were resistant to ertapenem, ertapenem seems to be the most sensitive agent in screening carbapenemases in areas where OXA-48 is prevalent and phenotypic combination tests can be useful in centers where molecular tests are not available.
  • No Thumbnail Available
    PublicationMetadata only
    Karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae ve Escherichia coli İzolatlarının Kolistine, Seftazidim-Avibaktama Duyarlılıkları ve Karbapenem Direnç Mekanizmaları
    (2022-12-01) ÜLGER, NURVER; İLKİ, ZEYNEP ARZU; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; KÜÇÜKSU U., AKILLI F. M., ÜLGER N., İLKİ Z. A., SAYIN E., HASDEMİR GÖKBOĞA M. U.