Person: MELETLİ, FURKAN
Loading...
Email Address
Birth Date
Research Projects
Organizational Units
Job Title
Last Name
MELETLİ
First Name
FURKAN
Name
4 results
Search Results
Now showing 1 - 4 of 4
Publication Metadata only Kumarin türevlerinin fizyolojik pH’da sığır serum albümine bağlanmasının spektral ve moleküler yerleştirme ile incelenmesi(2022-10-05) MELETLİ, FURKAN; DANIŞ, ÖZKAN; OGAN, AYŞE; Meletli F., Kazancıçok Z., Akın N., Danış Ö., Ogan A.Serum albümin, kan plazmasında en yaygın bulunan proteinlerden biridir. Ozmotik basıncın ayarlanması,kan pH’nın belirlenmesi ve serbest radikallerin azaltılması gibi birçok farklı fizyolojik görevlerinin yanı sırakanda bulunan endojen ve eksojen maddelerin (yağ asitleri, ilaçlar ve metabolitler vb.) taşınmasında birincilişlevi olan çok fonksiyonlu ve önemli bir proteindir. İlaçlar hedeflerine ulaşmak için kan plazmasındataşınırken kaçınılmaz olarak serum albümin ile etkileşime girmektedirler. Serum albümin ile ilaç etkileşimiilacın terapötik etkisi hakkında bilgi vermektedir. Bu etkileşimlerin incelenmesi ilaç kimyasında, tıpta,biyoteknolojide ve biyokimyada önemli bir araştırma alanıdır. Sığır serum albümin (BSA), 582 amino asitkalıntısından oluşan ve insan serum albümini ile %76 benzerliği olan bir proteindir. Düşük maliyetli olması,yaygın olarak bulunabilmesi ve saflaştırma işleminin kolay olması nedeniyle BSA, araştırmacılar tarafındanligandların proteine bağlanma çalışmaları için sıklıkla tercih edilen, protein-ilaç etkileşimleri ve bağlanmamekanizmalarının belirlenmesi için model olan bir taşıma sistemidir. Kumarinler bir benzen halkası ilebir α-piron halkasının kaynaşması sonucu oluşan benzopiron adı verilen bir bileşik sınıfının üyesidirler.Doğal olarak bitkilerde bulunabildiği gibi sentetik olarak da elde edilebilmektedir. Kumarinlerin sahipoldukları konjuge çift halka sistemleri, onları farklı araştırma alanları için ilginç moleküller haline getirmiştir.Kumarin türevleri geniş bir biyolojik aktivite yelpazesi sergilemektedirler. Bunlar arasında anti-oksidan,anti-enflamatuar, anti-bakteriyel, anti-viral, anti-tümör ve anti-koagülan özellikleri öne çıkmaktadır.Kumarinler tıpta ve özellikle ilaç endüstrisinde yaygın olarak kullanılmaktadırlar. Çalışmamızda uygunEmilim, Dağılım, Metabolizma ve Atılım (ADME) özelliklerine göre farmakokinetik ve farmakodinamiketkileri iyi olan daha önceden sentezlenmiş ve karakterize edilmiş kumarin türevlerinin BSA’ya bağlanmalarıve taşınmaları in silico ve in vitro yöntemlerle araştırılmıştır. In silico çalışmalarda moleküler yerleştirme(moleküler docking) ve in vitro çalışmalarda UV-vis absorbans, floresans gibi multi-spektroskopik yöntemlerkullanılmıştır. BSA ile kumarin türevlerinin etkileşimleri in silico ve in vitro yöntemlerle aydınlatılmıştır. Insilico çalışmalar sonucunda kumarinlerin bağlanma enerjileri, ligand verimliliği değerleriyle birlikte proteinligandetkileşimleri ve konformasyonları belirlenmiştir. Ayrıca in vitro multi-spektroskopik analizlerindeğerlendirilmesiyle; bileşikler BSA’nın floresans şiddetinde, absorbansında ve ikincil yapısında değişikliklerizlenmiş, kuençleşme mekanizmaları, bağlanma sabitleri ve bağlanma bölgelerinin sayıları belirlenmiştir.Publication Metadata only Çeşitli Kumarin Bileşiklerinin Nitrit Oksit Sentaz İzoenzimleri ile Olan İlişkisinin In Siliko Olarak İncelenmesi(2022-10-05) MELETLİ, FURKAN; DANIŞ, ÖZKAN; ERDEM, SAFİYE; Meletli F., Ergüven B., Danış Ö., Erdem S.Nitrik oksit (NO), gaz halinde bulunan bir sinyal molekülüdür. Nitrik oksit sentazlar (NOS) ise, arjininden nitrik oksit sentezleyen enzimlerdir. Nitrik oksit sentazın (NOS) insanda 3 izoformu bulunmaktadır. Bunlardan nöronal nitrik oksit sentaz (nNOS) ve endotelyal nitrik oksit sentaz (eNOS) NO üretimi üzerinde etkili iken, indüklenebilir nitrik oksit sentaz (iNOS) ise patojenlere karşı bağışıklık işlemlerinde etkili olurlar.Bu üç enzimde birbirine çok yakın bir yapıya sahiptir. Bu yüzden seçimli inhibitörlerin belirlenebilmesi için farklı ligandlar kullanılarak enzimlerin aktif bölgelerindeki farkları incelemek gerekmektedir. Nöronal nitrik oksit sentazın seçimli inhibisyonu, sinir sistemi üzerinde etkili olan Parkinson ve Alzheimer gibi hastalıklara karşı umut verici tedavi yaklaşımı olarak ortaya çıkmaktadır.Kumarinler, 1,2-benzopiron (C9H6O2) olarak karakterize edilen ve yaygın olarak bitkilerde bulunan doğal ürünlerdir. Ayrıca, bitkiler dışında sentetik olarak üretilmekte olup, bazı bakteri ve mantar türlerinde bulunurlar. Kumarinler, geniş bir yelpazede farklı farmakolojik özellikler göstermektedir. Literatürde kumarin türevlerinin; anti-koagülanlar, anti-HIV ajanları, anti-oksidanlar, anti-tümörler ve serbest radikal temizleyicileri olarak farmakolojik olarak yararlı olduğu ve endüstriyel alanlarda geniş uygulamalara sahip olduğu bilinmektedir. Bu çalışmamızda çeşitli kumarin bileşiklerin nitrik oksit sentaz izoenzimleri üzerindeki etkilerinin moleküler doking yoluyla in siliko olarak incelenmiştir. Ayrıca bu çalışmada kullanılan kumarin bileşiklerinin Emilim, Dağılım, Metabolizma ve Atılım (ADME) özellikleri ve Lipinski 5 kuralına uygunluğu da araştırılmıştır. Bu duruma uygun olan kumarin bileşikleri protein veri bankasından indirilen enzimlerle moleküler doking çalışmaları gerçekleştirilmiş ve bu enzimlere bağlanma durumları incelenmiştir. Moleküler doking sonucunda nNOS enzimine bağlanma afinitesi güçlü olan kumarin türevleri ileride Parkinson ve Alzheimer gibi sinir sistemini etkileyen hastalıklara karşı yeni ilaçların geliştirilmesinde katkıda bulunabileceği düşünülmektedir.Publication Open Access Investigation of the Interaction of Monoamine Oxidase (MAO) Inhibitor Biscoumarins with Hemoglobin and Albumin Using Multi-Spectroscopic Techniques and Molecular Docking(2024-01-01) MELETLİ, FURKAN; DANIŞ, ÖZKAN; Mutafoğlu B. S., MELETLİ F., DANIŞ Ö.Coumarin and their derivatives, such as biscoumarins, which are found as active ingredients in a variety of drugs, possess a wide range of biological activities. In this paper, the inhibitory effects of biscoumarin derivatives B1 and B2 on monoamine oxidase (MAO) enzyme activity were studied. Their binding mechanism to bovine serum hemoglobin (BHb) and bovine serum albumin (BSA) was investigated using molecular docking and multi-spectroscopic methods such as absorption, fluorescence, and synchronized fluorescence spectroscopy. The fluorescence quenching processes were analyzed using the Stern-Volmer, Lineweaver-Burk, and Hill methods. In this regard, Stern-Volmer quenching constants (Ksv), Lineweaver-Burk constants (KLB), and binding constants (Ka) were calculated at three temperatures (298, 310 and 322 K). The fluorescence studies showed that the binding of biscoumarins to BHb or BSA was a driven by static quenching. The Ka values of B2 to BHb and BSA (2179.11 and 18453.98 x 105 M-1) was larger than B1 at corresponding temperature (62.75 and 599.90 x105 M-1 for BHb and BSA, respectively), which indicates that the affinity of B2 toward the proteins were higher than that of B1. Moreover, thermodynamic parameters explained that hydrogen bonds were the main binding force stabilizing the protein-ligand complexes. Additionally, molecular docking studies have revealed binding energies, ligand efficiency values, and interactions with amino acid residues of proteins. The results of these investigations may be helpful in analyzing drug-protein binding of biscoumarins for potential future applications.Publication Open Access Design, synthesis and biological evaluation of novel benzocoumarin derivatives as potent inhibitors of MAO-B activity(2024-11-15) MELETLİ, FURKAN; DEMİR, SERAP; DANIŞ, ÖZKAN; MELETLİ F., Gündüz C., Alparslan M. M., ATTAR A., DEMİR S., İskit E., DANIŞ Ö.The continued research of novel reversible inhibitors targeting monoamine oxidase (MAO) B remains crucial for effectively symptomatic treatment of Parkinson\"s disease. In this study we synthesized and evaluated a new series of 3-aryl benzo[g] and benzo[h] coumarin derivatives as MAO-B inhibitors. Compound A6 has been found to display the most potent inhibitory activity and selectivity against the MAO-B isoform (IC50 = 13 nM and SI = >7693.31 respectively). Inhibition mode of A6 on MAO-B was predicted as mixed reversible inhibition with a Ki value of 3.274 nM. Furthermore, in order to elaborate structure–activity relationships, the binding mode of A6 was investigated by molecular docking simulations.