Person: ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY
Loading...
Email Address
Birth Date
Research Projects
Organizational Units
Job Title
Last Name
ÇİMŞİT
First Name
NURİ ÇAGATAY
Name
19 results
Search Results
Now showing 1 - 10 of 19
Publication Open Access Evaluation of BioFire Filmarray panel for respiratory pathogens: A demographic and clinical analysis in Istanbul, Turkey(2023-05-01) KARAHASAN, AYŞEGÜL; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; Karahasan A., Çimşit N. Ç.We aimed to analyze the distribution of respiratory pathogens(RP) detected by a multiplex PCR-based method (BioFire Diagnostics, USA) among patients with suspected respiratory tract infections (RTI) and to evaluate the demographic, clinical and radiological characteristics of infected individuals . RP were detected in 1621/6376 (25.4%) of the samples in the years 2018-2020. Rhinovirus/enterovirus (RV/EV) were the most commonly detected pathogens (38.1%) followed by influenza A and B viruses (21%) and parainfluenza virus (PIV) (9.5%). Single pathogen was detected in 1361 (84%) and multi pathogens in 260 (16%) of 1621 samples. At least one comorbidity was present in 379 (30.5%) of the patients. Fever was the most common sign followed by cough and dyspnea. Thorax CT was present in 426 of 1243 RP positive patients (34.3%). Any radiological findings was found significantly related for a specific pathogen. No medication was given to 52.9% whereas antibiotics in 35.7% and antivirals in 3.8% of the patients. Film Array panel as a multiplex PCR test is not used rationally in our hospital and results were not dramatically improve management of RTI. A better communication between clinician and microbiologist is required for efficient use of laboratory and rational use of antimicrobials.Publication Metadata only Pelizaeus-merzbacher-benzeri hastalık: GJC 2 gen mutasyonlu pediatrik bir olguda manyetik rezonans görüntüleme bulguları(2021-10-31) YAPICI, ÖZGE; POLAT, HAMZA; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; YAPICI Ö., ALMUS E., ASLAN B., POLAT H., ÖZTÜRK G., ÇİMŞİT N. Ç.Giriş-Amaç: Pelizaeus-Merzbacher benzeri hastalık (PMBH), bir gap-junction proteini olan connexin’i (Cx47) kodlayan GJC2 genindeki mutasyonların neden olduğu otozomal resesif bir hastalıktır (1). PMLD, X’e bağlı Pelizaeus-Merzbacher hastalığı (PMH) ile aynı klinik ve radyolojik özellikleri paylaşır, ancak PMH’da beklendiği gibi PLP1 geninde bir mutasyon yoktur. Manyetik Rezonans Görüntüleme (MRG)’de hipomiyelinasyon ile, klinik açıdan ise erken başlangıçlı nistagmus, gecikmiş motor kilometre taşları, progresif spastisite ve ataksi ile karakterizedir (1,2). Burada, GJC 2 gen mutasyonuna sahip 22 aylık bir erkek çocuğunun MRG bulgularını sunuyoruz. Olgu Sunumu: 22 aylık erkek bebek, konuşma ve motor disfonksiyonu şikayetleri ile kranial MRG için radyoloji bölümüne sevk edildi. Fizik muayenesinde bilateral nistagmus ve görme kaybı mevcuttu. Geçmiş klinik öyküsünde 38. gebelik haftasında 2. derece akraba evliliğinden sezaryen ile doğduğu öğrenildi. 6. ayda başını tutma, 9. ayda desteksiz oturma, 12. ayda emekleme yeteneğine sahipken desteksiz yürüyebilme yeteneği hiç gelişmemişti. Kraniyal MRG’de, subkortikal ve periventriküler beyaz cevherde, internal ve eksternal kapsüllerde, beyin sapı ve korpus kallozumda T2 ağırlıklı görüntülerde (T2AG) simetrik hiperintensite izlendi (Şekil 1). T1 ağırlıklı görüntülerde (T1AG) serebrum ve serebellum’da gri ve beyaz cevher arasındaki ayrımın kaybolması, hipomyelinasyon ile uyumlu olarak değerlendirildi(Şekil 2). Sentrum semiovale, korpus kallozum ve mezensefalonun bazı kısımlarında T1AG’de hafif hiperintensite görülmesi bu düzeylerde az da olsa miyelinasyonun gerçekleştiğini düşündürmekte idi (Şekil 2). MRG’yi takiben genetik test için sevk edilen olgunun, homozigot GJC2 mutasyonuna sahip olduğu bulundu. TartışmaSonuç: PMBH, PMH’dakine benzer şekilde, beyinde miyelin birikiminin kalıcı kaybına bağlı klinik olarak nistagmus, serebellar ataksi ve spastisite ile karakterizedir (3). PMH’nın aksine PMBH’de semptomlar daha yavaş ilerler, kognitif fonksiyonlar daha çok korunur ve MRG’de kortikospinal traktların parsiyel miyelinasyonu görülür (3). PMBH olgularında, PMH ile benzer şekilde, kranial MRG’de serebral beyaz cevherde homojen T2 hiperintensite şeklinde prezente olan yaygın hipomiyelinasyon paterni görülür (2). Kortikospinal yolların değişken miyelinasyonu ile birlikte, pons’un T2 hiperintensitesi tipiktir. Olgumuzda gözlemlediğimiz gibi iç kapsülün arka bacağında kısmi miyelinasyon da bildirilmiştir (1,3). Olgumuzda olduğu gibi, serebellar beyaz cevher, korunmuş hacmi ile daha az etkilenebilir. Bazal ganglionlar ve talamus genellikle normaldir (1). Olgumuzun tanısı, daha ileri radyolojik inceleme gerektirmeden genetik çalışmalarla konmuştur. PMBH için spesifik bir tedavi yoktur ve tıbbi bakım çoğunlukla destekleyici tedavi ile sınırlıdır (2)Publication Metadata only Accuracy and reliability of magnetic resonance imaging in the diagnosis of idiopathic intracranial hypertension(2022-10-01) ULUÇ, KAYIHAN; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; ILGIN, CAN; DERİCİOĞLU, VOLKAN; KAHRAMAN KOYTAK, PINAR; Kuzan B. N. , ILGIN C., Kuzan T. Y. , DERİCİOĞLU V., KAHRAMAN KOYTAK P., ULUÇ K., ÇİMŞİT N. Ç.© 2022 Elsevier B.V.Purpose: To determine the diagnostic utility of brain magnetic resonance imaging (MRI) findings in patients with idiopathic intracranial hypertension (IIH) and to investigate the significance of evaluating radiological findings together with neurological and ophthalmological data in the diagnosis of IIH. Materials and Methods: All consecutive patients diagnosed with IIH in our tertiary neuro-ophthalmology center between January 1, 2018 and March 15, 2020, were included in the study. The clinical, radiological, and ophthalmological findings of IIH patients were compared with the control group with similar demographic characteristics. Results: A total of 98 patients, 49 cases and 49 controls, were included in the study. Lateral ventricular index had the highest area under the curve (AUC) value (0.945) for prediction of disease group followed by sella height category (AUC = 0.915) and optic nerve tortuosity (AUC = 0.855) According to the multivariate model we developed, caudate index (OR = 0.572, 95% CI 0.329–0.996), lateral ventricle index (OR = 3.969, 95% CI 1.851–8.509) and bilateral optic nerve tortuosity (OR = 22,784, 95% CI 2.432–213.450) were significant predictors for disease group. Conclusion: Tortuosity in the optic nerve, lateral ventricular index and caudate index can be used as MRI parameters supporting the diagnosis of IIH in clinically suspicious cases. A holistic approach to the clinical and radiological findings of the cases in the diagnosis of IIH can prevent overdiagnosis and enable early correct diagnosis.Publication Metadata only Kolorektal kanser için geç kalibre cam mikroküreler ile tedavi etkinliğinin kantitatif PET/BT tabanlı değerlendirilmesi(2023-04-26) KESİM, SELİN; SOYDEMİR, EFE; BALABAN GENÇ, ZEYNEP CEREN; BALTACIOĞLU, FEYYAZ; ÖZDEMİR, BERDAN; ÖZGÜVEN, SALİH; FİLİZOĞLU, NUH; ENGÜR, CEREN ÖZGE; TUROĞLU, HALİL TURGUT; ERDİL, TANJU YUSUF; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; ÖNEŞ, TUNÇ; Kesim S., Soydemir E., Balaban Genç Z. C., Baltacıoğlu F., Kıssa T. N., Özdemir B., Özgüven S., Filizoğlu N., Niftaliyeva K., Engür C. Ö., et al.Amaç: Transarteriyel radyoembolizasyonda (TARE) kullanılan Y-90 ile işaretli cam mikroküreler, kalibrasyon tarihinden 12 gün sonrasına kadar kullanılabilir. Metastatik kolorektal kanser (mKRK) olgularında yarı ömrü uzadıkça daha düşük spesifik aktivitede ve daha fazla sayıda mikroküre ile farklı bir tedavi opsiyonu sunan bu geç kalibreY-90 cam mikroküreler için literatür bilgisi sınırlıdır. mKRK olguları için tedaviye yanıtın değerlendirilmesinde florodeoksiglukoz (FDG) pozitron emisyon tomografi (PET)/bilgisayarlı tomografi (BT) ve bu görüntüleme yöntemi ile elde edilen kantitatif değerlendirme kriterleri olan metabolik tümör volümü (MTV) ve total lezyon glikoliz (TLG) kavramları nekrotik tümör dokusundan bağımsız olarak tümör yükünü daha doğru bir biçimde saptamaktadır. Bu çalışmada, geç kalibre Y-90 cam mikroküreler ile TARE uygulanan olgularda tedavi etkinliğini tedavi öncesi/sonrası FDG PET/BT görüntülemelerinden elde edilen kantitatif ölçümler ile değerlendirmeyi amaçladık. Yöntem: Çalışmaya geç kalibre Y-90 cam mikroküreler ile tedavi edilen toplam 77 mKRK olgusu/93 TARE seansı dahil edildi. Tüm tedaviler için SimplicitY-90™ yazılımı kullanılarak gerekli dozimetrik hesaplamalar yapıldı (Şekil 1). Tedavi öncesi ve tedavi sonrası 9-10. hafta FDG PET/BT görüntülemeleri gerçekleştirilerek \"bazal\" ve \"takip\" MTV ve TLG değerleri hesaplandı. (MTV/Gray)x100 ve (TLG/Gray)x100 değerleri (birim MTV/TLG için absorbe edilen doz sabit değeri) hesaplandı. Olgular \"Tedaviye Tam Yanıt-TY\", \"Parsiyel Yanıt-PY\", \"Stabil Hastalık-StH\" ve \"Progrese HastalıkPH\" olmak üzere 4 ayrı grupta değerlendirildi ve \"Hastalık Kontrol OranıHKO\" hesaplandı(Şekil 2). Genel sağkalım (GS) ve ilk tedavi sonrası sağkalım (İTSS) süreleri belirlendi. Doz/toksisite profili için olgular tedavi sonrası 2, 4, 8. haftalarda CTCAE skorlama sistemi ile değerlendirildi. TARE’ye bağlı kronik hepatotoksisite olasılığı açısından olgular tedavi sonrası en az 6 ay takip edildi. Bulgular: Doksan üç tedavi için: On olguda TY; 36 olguda PY; 33 olguda StH; 14 olguda PH saptandı. HKO %84,9 olarak bulundu. Tedavi öncesi birim TLG ve MTV değeri için absorbe edilen doz maruziyeti arttığında tedaviye yanıt oranında istatistiksel olarak anlamlı artış saptandı (p=0,004 vep=0,005). Karaciğere ulaşan mikroküre sayısında artış ile tedavi yanıtı arasında tüm olgular birlikte değerlendirildiğinde anlamlı bir istatistiksel ilişki kurulamazken(p=0,131)TY ve PY olgularında; StH ve PH olgularına kıyasla karaciğere ulaşan mikroküre sayısında anlamlı bir artış dikkati çekti (p=0,022). Tedavi öncesi birim TLG ve MTV değeri için absorbe edilen doz maruziyeti arttığında gerek GS gerekse İTSS sürelerinin istatistiksel olarak anlamlı bir artış gösterdi (p=0,003 ve p=0,007, Şekil 3). Doz/toksisite profili için yapılan değerlendirmede geç postkalibre Y-90 cam mikroküre tedavisinin klinik olarak anlamlı sayılabilecek ek yan etki/hayati risk oluşturmadı görüldü. Bununla birlikte, karaciğere ulaşan mikroküre sayısı arttıkça sağlıklı karaciğer parankiminin radyasyon maruziyetinin artış gösterdiği dikkati çekti (p<0.001). Sonuç: Çalışmamız, geniş bir kohortta geç postkalibre Y-90 cam mikrokürelerin tedavi etkinliğini/güvenliğini göstermiştir. F-18FDG PET/BT ile elde edilen kantitatif ölçümler ışığında, etkin bir tedavi/daha uzun GS elde edebilmek için güvenilir absorbe edilen doz maruziyetinin ve karaciğere ulaşan mikroküre sayısının MTV ve TLG kavramları ile olan ilişkisi, geç kalibre cam mikroküreler için literatürde ilk kez ayrıntılı ve net bir şekilde ortaya konmuştur. Anahtar Kelimeler: Transarteriyel radyoembolizasyon, metastatik kolorektal kanser, geç kalibre Y-90 cam mikroküreler, total lezyon glikolizi, metabolik tümör volümüPublication Metadata only Assessing the construct validity of the novel OMERACT ultrasound scoring system for salivary glands target lesions by comparison with MRI in patients with sjogren's syndrome - An OMERACT ultrasound working group exercise(2020-10-01) ÇİMŞİT, CANAN; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; Inanc N., Jousse-Joulin S., Abacar K., Cimsit C., Cimsit C., D'Agostino M., Naredo E., Hocevar A., Finzel S., Terslev L., et al.Publication Metadata only The evaluation of lung ct densitometry in interstitial lung diseases(2020-05-05) KOCAKAYA, DERYA; ERYÜKSEL, SEMİHA EMEL; İNANÇ, GÜZİDE NEVSUN; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; ŞENGÜL Y., KOCAKAYA D., ILGIN C., ERYÜKSEL S. E. , İNANÇ G. N. , ÇİMŞİT N. Ç. , ŞENGÜL Y.Publication Metadata only Volumetric properties of paranasal sinuses in thin-section craniofacial computedtomography images using interactive segmentation method(2021-09-01) VERİMLİ, URAL; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; BUĞDAYCI, ONUR; SANCAKLI B., VERİMLİ U., BUĞDAYCI O., ÇİMŞİT N. Ç.Aim: The aim of this study is to examine the volumetric properties of the paranasal sinuses by creating threedimensional reconstructions of high-resolution images obtained by computed tomography by interactive segmentation method. Material and Methods: Thin-section multidetector computed tomography images of 40 female and 40 male individuals between the ages of 20-40 without cranium pathology will be evaluated retrospectively. The volumetric characteristics of the paranasal sinuses will be evaluated in terms of the age and gender of the sample group. The observed variations and mucosal thickness changes in the sinus walls will be determined. Computed Tomography images were transferred to the Imfusion Suite Demo software and volume measurement was performed separately for the right and left by segmentation method. Results: In our study, a statistically significant difference was observed between male individuals for sphenoidal sinus (p=0.0354), and a gender-related difference was observed for frontal sinus (p=0.0033) and maxillaris sinus (p=0.0104) in the same age group. Conclusion: Eventually we aim to obtain comprehensive morphometric information for paranasal sinuses and provide crucial information for clinical applications. Measurement, examination and analysis of paranasal sinus volumes are expected to reduce time required and benefit the anatomical outcomes for certain surgical interventions.Publication Open Access Evaluation of the inferior alveolar nerve with 3 tesla turbo spin echo magnetic resonance imaging(2022-12-01) BORAHAN, MEHMET OĞUZ; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; BOZKURT M., BORAHAN M. O., ÇİMŞİT N. Ç.Objectives: The purpose of this study is to evaluate the inferior alveolar nerve’s position and nerve plexus within the mandibular canal (MC) with turbo spin echo (TSE) sequences of magnetic resonance imaging (MRI). Methods: The IAN position was evaluated retrospectively in 220 patients as right and left mandibles (n=440). IAN was classified according to topographical features and branches. MRI images were evaluated as the sequences of T1-weighted, T2- weighted and Proton Density TSE images with standard scanning protocols. Additionally, location of the nerve plexus was recorded as anterior, premolar, molar and retromolar regions. Results: Patient age was in the range of 7-81 years and the mean age was 37.23 ±16.38. Most common type was Type I (75.2%) which identifies a single major branch of IAN, followed by Type II (21.8%) that identifies inferiorly located and extended branching IAN, and Type III (3%) which represents IAN divides posteriorly into two major branches. Also, it was found that molar region nerve plexus (66.2%) was significantly higher than other regions. Conclusions: MRI is a non-invasive soft tissue imaging method and is an alternative promising modality regarding in the evaluation of IAN. Preoperative MRI examination may help surgical planning of mandible molar region to avoid complications.Publication Metadata only Kistik Fibrozisli bir olguda nadir pankreatik tutulum: pankreatik sistozis(2021-10-31) YAPICI, ÖZGE; ASLAN, BÜLENT; ŞAHİN AKKELLE, BİLGE; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; ALMUS E., YAPICI Ö., ALMUS F., ASLAN B., ŞAHİN AKKELLE B., ÇİMŞİT N. Ç.Publication Metadata only Pulmoner nodül rezeksiyonu yapılan olgularda klinik radyolojik bulguların malign histopatolojik tanılar ile korelasyonu(2023-05-09) OLGUN YILDIZELİ, ŞEHNAZ; KOCAKAYA, DERYA; ERMERAK, NEZİH ONUR; BOZKURTLAR, EMİNE; ERYÜKSEL, SEMİHA EMEL; ÇİMŞİT, NURİ ÇAGATAY; YILDIZELİ, BEDRETTİN; KARAKURT, SAİT; OLGUN YILDIZELİ Ş., GİVİVİ S., KOCAKAYA D., ERMERAK N. O., BOZKURTLAR E., ERYÜKSEL S. E., ÇİMŞİT N. Ç., YILDIZELİ B., KARAKURT S.Pulmonary nodules are common (nc(dental f(nd(ng on thorac(c computed tomography (CT) and st(ll a problem (n da(ly pulmonary pract(ce. Because of the w(dely usage of CT scans an (ncreased number of pat(ents follow up w(th th(s d(agnose. Nodules may or(g(nated secondary to ben(gn d(seases but pr(mary concern (s mal(gnanc(es wh(ch (s (mportant for early d(agnos(s and curat(ve opt(ons. On the other hand (t (s not cost-effect(ve follow(ng up the ben(gn les(ons w(th an add(t(onal cumulat(ve rad(at(on dose espec(ally (n prolonged durat(on. Many pred(ct(on models were proposed to evaluate the potency of mal(gnancy us(ng cl(n(cal and rad(olog(cal f(nd(ngs Mayo cl(n(c (1), Veterans Assoc(at(on (2), Brock Un(vers(ty (3) and lastly Herder model (4) mostly used models for r(sk strat(f(cat(on. Herder r(sk model evaluates also Flour(ne– flourodeoxyglucose (FDG) uptake (n pos(tron em(ss(on tomography-computed tomography (PET-CT). Comparat(ve study of these models showed non-super(or(ty to each other, added value of PET-CT (s unden(able for larger nodules but not clear for small nodules (< 8mm) (5). Mult(d(sc(pl(nary follow up, careful observat(on and d(agnost(c test(ng are st(ll h(ghly recommended espec(ally for (ndeterm(ne nodules