Publication: Meme kanserinde insulin benzeri büyüme faktörü bağlayan protein-5 geni promotor ve ekzon-1 metilasyonunun gen ekspresyonu üzerine etkisi
No Thumbnail Available
Date
2013-10-27
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
İnsulin benzeri büyüme faktörü (İGF-)-bağlayan protein-5 (İGFBP5),
meme kanserinde hücre farklılaşması, metastaz, apoptoz, hücre
büyümesi gibi biyolojik süreçlerde önemli fonksiyonlara sahip bir
büyüme faktörüdür. DNA metilasyonu gibi epigenetik mekanizmalar
gen ekspreyonu regülasyonunda önemli rol oynamaktadırlar. Bu
çalışmanın amacı insan meme kanseri ve onların sağlıklı dokularında
İGFBP5 geni promotor ve ekzon-1 bölgelerinin metilasyon düzeyini
belirlemek ve bunun İGFBP5 ekspresyonuna etkisini ortaya
çıkarmaktır. Çalışma 35 meme kanseri hastasından alınan 70
örnek (tümör ve komşu sağlıklı dokular) ile gerçekleştirildi. DNA
metilasyon durumlarını ortaya çıkarmak için metilasyon spesifik
PZR (MSP), metilasyonun ekspresyon üzerine etkisini belirlemek
için ise gerçek zamanlı PZR (real time-PCR) tercih edildi. IGFBP5
ekspresyon analizi yapılan 14 örnekten üçünde DNA metilasyonu ile
mRNA ekspresyonu arasında bir ilişki saptanmıştır. Bu örneklerden
ilkinde kanserli dokuda promotor bölgesinin ve ikinci örnekte ekzon
bölgesinin metilasyonunun azalması, sağlıklı dokuya oranla gen
ekspresyonunu arttırmış, üçüncü örnekte ise yine kanserli dokuda
artan ekzon metilasyonu mRNA ekspresyonunun azalmasına sebep
olmuştur. Araştırılan 35 örneğin 11’nde kanserli ve sağlıklı doku
arasında promotor ve ekzon bölge metilasyon kalıplarının farklı
olduğu, diğerlerinde ise sağlıklı doku ve kanserli dokunun nerdeyse
aynı metilasyon kalıbına sahip olduğu görülmüştür. İGFBP5 geni
hem kanserli hem de sağlıklı dokuda ekzon bölgesi için çoğunlukla
metillenmemiş, promotor bölgesi için çoğunlukla metile bantlar
vermiştir. Elde edilen veriler ışığında İGFBP5 geni exon-1 ve
promotor bölge metilasyon kalıplarının gen expresyonu üzerine
etkili olduğu düşünülmektedir. İGFBP5 geni ekspresyon analiz
çalışmaları devam etmektedir.
Description
Keywords
Citation
KARABULUT UZUNÇAKMAK S., KAYA Z., GÜLLÜ AMURAN G., PEKER EYÜBOĞLU İ., ÖZMEN T., ERZİK C., ÖZER S. A., AKKİPRİK M., \"Meme kanserinde insülin benzeri büyüme faktörü bağlayan protein-5 geni promotör ve ekzon-1 metilasyonun gene ekspresyonu üzerine etkisi\", Tıbbi Biyoloji ve Genetik kongresi, Türkiye, 27 - 30 Ekim 2013