Clostridium difficile pozitif hastalarda norovirüs insidansının elisa ve moleküler yöntemlerle karşılaştırılması

Abstract

Clostridium difficile pozitif hastalarda norovirüs insidansının elisa ve moleküleryöntemlerle karşılaştırılmasıHanife Şura Şalcı, Zeynep Arzu İlki, Mikrobiyoloji Anabilim DalıAMAÇ: Yapılan bu çalışmadaki amaç, Clostridium difficile toksin pozitif hastaörneklerinde norovirüs varlığını iki farklı yöntemle, ELISA ve Moleküleryöntemlerle saptamaktır.GEREÇ VE YÖNTEM : Ocak 2019, Mart 2020 tarihleri arasında, Clostridiumdifficile toksin (CerTest, GDH + Toksin A+B (BIOTEC, İspanya)) hızlı tanı kiti ilepozitif bulunmuş 82 hasta örneği çalışmaya dahil edildi. Bu örneklerde iki yöntemlenorovirüs varlığı araştırılmıştır. Çalışmanın ilk aşamasında ELISA (RIDASCREENNorovirüs kiti (R-Biopharm, Darmstdt, Almanya)) ile norovirüs antijeni aranmıştır.İkinci aşamasında ise aynı örneklerde gerçek zamanlı RT-PZR yöntemi (CorbettRotor-Gene 6000 HRM ) kullanılarak nükleik asit aranmıştır.BULGULAR: Çalışmaya dahil edilen toplsm 82 örnekte ELISA ile norovirüspozitifliği %3,7 (n:3) olarak bulunmuştur. Aynı örneklerin gerçek zamanlı RT-PZRsonucunda ise norovirüs pozitifliği %8, 5 (n:7) olarak değerlendirilmiştir. RT-PZRreferans alındığında, ELISA testinin duyarlılığı %63,6, özgüllüğü %100 olarak tespitedilmiştir.SONUÇ : Çalışmamızda C. difficile toksin pozitif hastalarda % 8,5 oranındanorovirüs ile koenfeksiyon görülmüş, bu azımsanmayacak oran literatürle uyumlugözükmektedir. Klinisyenler özellikle uzun süreli yatış hikayesi, immun yetmezliğiolan C.difficile toksin pozitif hastaları için olası norovirus enfeksiyonunu da aklagetirmelidir. Uzun süren, tedavi etmekte zorluk yaşanan ishalli hastalarda,enteropatojenler arası etkileşimleri düşünmek, farklı tanı arayışlarına girmek vetedaviyi buna göre yönlendirmek önemlidir.

Comparison of norovirus incidence with elisa and molecular methods inClostridium difficile positive patientsHanife Şura Şalcı, Zeynep Arzu İlki, Mikrobiyoloji Anabilim DalıObjective: The aim of this study is to detect the presence of norovirus in Clostridiumdifficile toxin positive patients with two different methods, ELISA and Molecularmethods.Material and methods: Between January 2019 and March 2020, 82 patient samplesfound positive with the Rapid Diagnostic Kit of Clostridium difficile toxin (CerTest,GDH + Toxin A + B (BIOTEC, Spain)) were included. In these examples, noroviruswas investigated by two methods. The first stage of the study was to search fornorovirus antigen by ELISA (RIDASCREEN Norovirus kit (R-Biopharm,Darmstadt, Germany)). In the second stage, nucleic acid was searched in the samesamples using the real-time RT-PCR method (Corbett Rotor-Gene 6000 HRM).Results: Norovirus positivity was found as 3,7% (n: 3) by ELISA in a total of 82samples included in the study. Norovirus positivity in real-time RT-PCR of the samesamples was evaluated as 8,5% (n: 7). When the RT-PCR is taken as reference, thesensitivity of the ELISA test was 63,6% and the specificity was 100%.Conclusion: In our study, co-infection with norovirus was observed with a rate of8,5% in C. difficile toxin positive patients, and this rate is consistent with theliterature. Clinicians should consider possible norovirus infection, especially forC.difficile toxin positive patients with immunodeficiency. It is important to considerinteractions between enteropathogens, to search for different diagnoses and to directtreatment accordingly in patients with long-lasting diarrhea.