Person: YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE
Loading...
Email Address
Birth Date
Research Projects
Organizational Units
Job Title
Last Name
YILMAZ GÖLER
First Name
AYŞE MİNE
Name
15 results
Search Results
Now showing 1 - 10 of 15
Publication Open Access Cytotoxicity of Different Nano Composite Resins on Human Gingival and Periodontal Ligament Fibroblast Cell Lines: An In Vitro Study(MDPI, 2020-03-01) YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE; Kavuncu, Gamze; Yilmaz, Ayse Mine; Yilmaz, Betul Karademir; Atali, Pinar Yilmaz; Altunok, Elif Cigdem; Kuru, Leyla; Agrali, Omer BirkanThe aim of this study is to determine the cytotoxicity of three different nano composite resins (CRs) on human gingival fibroblast (hGF) and periodontal ligament fibroblast (hPDLF) cell lines. These CRs selected were nanohybrid organic monomer-based Admira Fusion (AF), nanohybrid Bis-(acryloyloxymethyl) tricyclo [5.2.1.0.sup.2,6] decane-based Charisma Topaz (CT), and supra nano filled resin-based Estelite Quick Sigma (EQS). MTT assay was performed to assess the cytotoxicity of CRs at 24 h and one week. AF and EQS applied on hGF cells at 24 h and one week demonstrated similar cytotoxic outcomes. Cytotoxicity of CT on hGF cells at one week was higher than 24 h (p = 0.04). Cytotoxicity of CT on hGF cells was higher at 24 h (p = 0.002) and one week (p = 0.009) compared to control. All composites showed higher cytotoxicity on hPDLF cells at one week than the 24 h (AF; p = 0.02, CT; p = 0.02, EQS; p = 0.04). AF and EQS demonstrated lower cytotoxicity on hPDLF cells than the control group at 24 h (AF; p = 0.01, EQS; p = 0.001). CT was found more cytotoxic on hPDLF cells than the control (p = 0.01) and EQS group (p = 0.008) at one week. The cytotoxicity of CRs on hGF and hPDLF cells vary, according to the type of composites, cell types, and exposure time.Publication Open Access Klorheksidinin insan dişeti fibroblastları üzerindeki hücre canlılığı ve sitotoksisite etkinliğinin in vitro koşullarda değerlendirilmesi(2023-04-01) YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE; ÖZTÜRK ÖZENER, HAFİZE; Bayraktar G., YILMAZ GÖLER A. M., ÖZTÜRK H.Amaç: Bu in vitro çalışmada, % 0,2’lik klorheksidin (CHX) solüsyonunun, insan dişeti fibroblast (HGF) hücre canlılığı ve sitotoksisitesi üzerindeki etkilerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Bu çalışma 30 saniye ve 2 dakikalık zaman aralıklarında, nötr pH değerindeki % 0,2’lik CHX solüsyonu ve hücre olarak ATCC’den ticari olarak temin edilen HGF-1 (CRL2014) hücre hatları kullanılarak gerçekleştirildi. CHX’in HGF üzerindeki hücre canlılığı etkileri 3-(4,5-dimetiltiazol-2-il)-2,5- difeniltetrazolyum bromür (MTT) testi ile ve sitotoksik etkileri laktat dehidrogenaz (LDH) testi ile değerlendirildi. Sonuçlar ortalama ve standart sapma değerleri kullanılarak two way ANOVA testiyle istatistiksel olarak analiz edildi (p<0,05). Bulgular: MTT testi sonuçlarına göre, % 0,2 CHX solüsyonunun zamanla hücre canlılığını azalttığı görüldü (p<0,0001). LDH testi sonuçlarına göre ise % 0,2 CHX’in sitotoksik etkinliğinin kontrol grubuna kıyasla arttığı (p<0,0001) ancak zaman içinde istatistiksel olarak anlamlı bir fark göstermediği (p>0,05) gözlendi. Sonuç: Bu in vitro çalışmanın sınırları dahilinde, % 0,2 CHX solüsyonu, 30 sn ve 2 dk’lık kısa maruz kalma sürelerinde, HGF hücre canlılığını azalttı ve HGF üzerinde sitotoksik etki gösterdi.Publication Open Access Effect of different immobilization media on breakdown of whey proteins by Streptococcus thermophilus(2022-05-01) YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE; Safak F. Z., Bıcım G., Yılmaz A. M., Aksu M. B., Yalcın A. S.Objective: In this study, we aimed to compare the efficiency of different immobilization media to facilitate breakdown of whey proteins by Streptococcus thermophilus (S. thermophilus). Materials and Methods: S. thermophilus was isolated from yoghurt. High-protein whey powder was present in fermentation media and two-phase dispersion technique was used for immobilization of S. thermophilus in agar, agarose and κ-carrageenan. Total protein after fermentation of whey proteins with S. thermophilus in different media was measured. We have also performed sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) analysis to observe changes in individual whey proteins after fermentation in different media. Results:Total protein concentration showed a significant decrease at the end of 24 hours of fermentation in all media. SDS-PAGE results showed that the amount of both α-lactalbumin and β-lactoglobulin were reduced in all immobilization media compared to control. The effect of κ-carrageenan was considerably higher compared to other media. Conclusion:Our results showed that immobilization in κ-carrageenan increased the breakdown of whey proteins by S. thermophilus and can be used to increase fermentation efficiencyPublication Metadata only Primary adrenal insufficiency in a patient with biallelic QRSL1 mutations(2022-09-01) YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE; GÜRAN, TÜLAY; Dursun F., Genc H. M. , YILMAZ GÖLER A. M. , Tas I., Eser M., Pehlivanoglu C., Yilmaz B. K. , GÜRAN T.Publication Metadata only Lakozamid ile birlikte karbamazepin, fenobarbital veya valproik asit kullanımının hepatik metabolizma üzerindeki in vitro etkileri(2021-11-06) YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE; GÜLHAN, REZZAN; GÜLÇEBİ İDRİZ OĞLU, MEDİNE; YILMAZ GÖLER A. M., ALTINOLUK T., ÇULPAN Y., Selalmaz Y., ONAT F., GÜLHAN R., GÜLÇEBİ İDRİZ OĞLU M.Amaç: Karbamazepin ve fenobarbital hepatik sitokromP450 (CYP) metabolizma enzimlerini indükleyerek, valproik asit ise inhibe ederek ilaçilaç etkileşimlerine yol açabilmektedir. Yeni jenerasyon anti-nöbet ilaçlardan (ASD) biri olan lakozamid (LCM), CYP2C19, CYP2C9 ve CYP3A4 enzimleri ile metabolizma olmaktadır. Çalışmamızda lakozamid ile birlikte kullanılan ASD’lerin CYP enzimleri üzerindeki etkilerini in vitro yöntemlerle mRNA düzeyinde araştırmayı amaçladık. Gereç ve Yöntem: İnsan hepatoselüler karsinom hücrelerine (HepaRG veya HepG2) terapötik konsantrasyonlarda karbamazepin, fenobarbital veya valproik asit uygulanmasının ardından, kuyucuklara kanda minimum veya maksimum terapötik konsantrasyonlara (Cmin veya Cmaks) karşılık gelecek şekilde LCM eklendi. Hücre örneklerinde CYP2C19, CYP2C9 ve CYP3A4 genlerinin mRNA ekspresyon düzeyleri gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ile ölçüldü ve değişiklikler kat değişimi (FC) değerleri olarak hesaplandı. FC değerleri 0,5’in altında kalan gen ekspresyonları inhibisyon, 2’nin üzerinde olanlar ise indüksiyon olarak değerlendirildi ve GraphPad Prism 8 ile analiz edildi. Bulgular: HepaRG hücrelerinde en yüksek mRNA ekspresyonu CYP2C19 ve CYP3A4 genlerinde karbamazepin ve LCMCmin'nin birlikte uygulandığı gruplarda (sırasıyla, FC:5,2; FC:1009,9) saptanırken, CYP2C9 gen ekspresyonu, fenobarbital ile LCMCmin uygulanan grupta anlamlı derecede yüksek bulundu (FC:795,16). HepaRG hücrelerinde valproik asit ile LCMCmaks uygulanan grupta en düşük CYP gen ekspresyonu CYP3A4 olarak tespit edildi (FC:2,3). HepG2 hücrelerinde ise CYP genlerinin ekspresyonları anlamlı değişiklik göstermedi. Sonuç: CYP enzim ekspresyonunun daha yüksek oranda gerçekleştiği HepaRG hücre hattı deneylerinden elde ettiğimiz sonuçlar özellikle karbamazepin ve fenobarbitalin CYP genlerinin ekspresyonlarını değiştirerek (sırasıyla CYP2C19-CYP3A4 ve CYP2C9) LCM ile etkileşmeye girebileceğine işaret etmektedir. Sonuçlarımızın doğrulanması için LCM konsantrasyonunun eş zamanlı olarak ölçülmesi ve deney sayılarının arttırılması planlanmaktadır. Çalışmamız Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu (TÜBİTAK) (119R041) tarafından desteklenmektedir.Publication Metadata only Synergistic Induction of Apoptosis by Quercetin and Curcumin in Chronic Myeloid Leukemia (K562) Cells: II. Signal Transduction Pathways Involved(ROUTLEDGE JOURNALS, TAYLOR & FRANCIS LTD, 2021) YALÇIN, AHMET SUHA; Altundag, Ergul Mutlu; Yilmaz, Ayse Mine; Serdar, Belgin Sert; Jannuzzi, Ayse Tarbin; Kocturk, Semra; Yalcin, A. SuhaFlavonoids are phenolic substances with chemo-preventive and chemotherapeutic properties. They are widely found in fruits and vegetables. The polyphenols quercetin and curcumin have antioxidant, anti-inflammatory, anti-carcinogenic, and pro-apoptotic properties. They were successfully used against different human cancers, especially chronic myeloid leukemia cancer cells. We have previously investigated anti-proliferative and apoptotic effects of quercetin and curcumin combination in K562 cells. Our data showed that they had beneficial synergistic effects. Based on these findings, we aimed to clarify signaling pathways involved in synergistic combination treatment with quercetin and curcumin in these cells. Proteins were investigated by Western blotting and by confocal microscopy. Changes in several genes in 10 different pathways related to cell proliferation, apoptosis, cell cycle, inflammation, hypoxia and oxidative stress were observed. Combination of quercetin and curcumin was effective on genes that were particularly related to p53, NF-kappa B and TGF-alpha pathways. Down-regulatory (CDKN1B, AKT1, IFN-gamma) and up-regulatory (BTG2, CDKN1A, FAS) effects on genes and related protein expressions may provide a multi-targeted therapy potential for chronic myeloid leukemia cancer cells without affecting healthy cells.Publication Metadata only Antinöbet ilaçların lakozamid konsantrasyonu üzerindeki etkilerinin HepaRG hücre hattında araştırılması(2021-11-04) GÜLHAN, REZZAN; YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE; GÜLÇEBİ İDRİZ OĞLU, MEDİNE; GÜLHAN R., YILMAZ GÖLER A. M., ALTINOK T., ÇULPAN Y., SELALMAZ Y., ONAT F., GÜLÇEBİ İDRİZ OĞLU M.Amaç: Epilepsi hastalığının farmakolojik tedavisinde kullanılan antinöbet ilaçlar (ASD) çoğu hastada beklenen etkiyi sağlarken, bazı hastalarda etkisiz kalmaktadır. İlaç yanıtında bireysel değişkenliğin nedenleri arasında, ilaç-ilaç etkileşimleri önemli bir yere sahiptir. Epilepsi tedavisinde kullanılan karbamazepin ve fenobarbital hepatik sitokrom P450 (CYP) metabolizma enzimlerini indükleyerek, valproik asit ise inhibe ederek ilaç-ilaç etkileşimlerine yol açabilmektedir. Yeni jenerasyon ASD’lerden biri olan lakozamid, CYP2C19, CYP2C9 ve CYP3A4 enzimleri ile metabolize olmaktadır. Hem hepatosit benzeri hem de safra benzeri hücrelerin bir karışımından oluşan insan hepatoselüler karsinom hücre hattı olan HepaRG hücreleri, in vitro ilaç metabolizmasının takibi, ilaç-ilaç etkileşimi ve toksikoloji çalışmalarında kullanılmak üzere geliştirilmiştir (Gripon ve ark. 2002; Lambert ve ark. 2009). HepaRG hücrelerinin karaciğer fonksiyonlarının ve karaciğere özgü genlerin ekspresyonunun primer hepatositler ile aynı seviyede olduğu gösterilmiştir (Anthérieu ve ark. 2010). Çalışmamızda ASD’lerin lakozamid konsantrasyonu üzerindeki etkilerini HepaRG hücre hattını kullanarak in vitro yöntemlerle araştırmayı amaçladık. Gereç-Yöntem: HepaRG hücre kültürlerine terapötik konsantrasyonlarda karbamazepin, fenobarbital veya valproik asit uygulanmasının ardından, kuyucuklara kanda minimum ya da maksimum terapötik konsantrasyonlara (Cmin veya Cmaks) veya toksik konsantrasyona (Ctoks) karşılık gelecek şekilde lakozamid eklendi. Kuyucuklardan alınan hücre örneklerinde CYP2C19, CYP2C9 ve CYP3A4 genlerinin mRNA ekspresyon düzeyleri gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ile ölçüldü. Hücrelerdeki CYP enzim miktarları ELISA yöntemi ile değerlendirilirken, hücre besi yerlerinden alınan örneklerdeki lakozamid ve O-desmetil lakozamid miktarları LC-MS/MS ile tespit edildi. Sonuçlar hesaplanarak GraphPad Prism 8 ile analiz edildi. Bulgular: HepaRG hücrelerindeki CYP2C19 geninde en yüksek mRNA ifadesi karbamazepin ve lakozamid Cmin'in uygulandığı grupta (FC:13,52) saptandı. Fenobarbital ile lakozamid Cmin uygulanan grupta saptanan CYP2C9 gen ekspresyonu (FC:339,78), lakozamid Cmaks grubu ile karşılaştırıldığında anlamlı derecede yüksekti (p=0,015). CYP3A4 gen ekspresyonu en yüksek karbamazepin ile lakozamid Cmaks’ın birlikte uygulandığı grupta tespit edildi (FC:1180,00). Karbamazepin ile lakozamid Cmaks grubunda mRNA ekspresyon değeri lakozamid Cmaks grubu ile karşılaştırıldığında anlamlı derecede yüksekti (p=0,007). ELISA yöntemiyle ölçülen enzim miktarları değerlendirildiğinde, CYP2C9 enzimi açısından gruplar arasında anlamlı bir farka rastlanmadı. CYP2C19 protein miktarları incelenen gruplarda en düşük CYP2C19 enzim miktarı tek başına karbamazepin uygulanan grupta bulundu (7,42±0,4 ng/ml). En düşük CYP2C19 enzim miktarı ise fenobarbital ile lakozamid Cmin grubunda tespit edildi (2,81±2,3 ng/ml). Her iki grupta da CYP2C19 enzimi açısından anlamlı bir farka rastlanmadı. En yüksek CYP3A4 enzim miktarına lakozamid Cmin grubunda rastlanırken (1015,96±2,14 pg/ml), kontrol grubu ile karşılaştırıldığında anlamlı bir farka rastlanmadı. En düşük CYP3A4 enzim miktarı ise fenobarbital ile lakozamid Cmin grubunda gözlendi (532,39±20,0 pg/ml) ve yalnızca lakozamid Cmin içeren gruptan anlamlı derecede düşüktü. En yüksek lakozamid/O-desmetil-lakozamid konsantrasyon oranı valproik asit ile lakozamid Cmin uygulanan grupta (176.9) tespit edilirken, bu oran en düşük fenobarbital ile lakozamid Cmaks uygulanan grupta (43.1) bulundu. Sonuç: CYP enzim ekspresyonunun indüklendiği HepaRG hücre hattı deneylerinden elde ettiğimiz sonuçlar özellikle karbamazepin ve fenobarbitalin CYP enzim genlerinin ekspresyonlarını değiştirerek (sırasıyla CYP3A4 ve CYP2C9) lakozamid ile etkileşmeye girebileceğine işaret etmektedir. Bu çalışma Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu (TÜBİTAK) (119R041) tarafından desteklenmektedir.Publication Open Access Exploring the anticancer effects of brominated plastoquinone analogs with promising cytotoxic activity in MCF-7 breast cancer cells via cell cycle arrest and oxidative stress induction(2022-06-01) YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE; YILMAZ, BETÜL; Jannuzzı A. T., Yılmaz Göler A. M., Bayrak N., Yıldız M., Yıldırım H., Yılmaz B., Shilkar D., Jayaprakash Venkatesan R., Jayaprakash V., Tuyun A. F.Plastoquinone analogs are privileged structures among the known antiproliferative natural product-based compound families. Exploiting one of these analogs as a lead structure, we report the investigation of the brominated PQ analogs (BrPQ) in collaboration with the National Cancer Institute of Bethesda within the Developmental Therapeutics Program (DTP). These analogs exhibited growth inhibition in the micromolar range across leukemia, non-small cell lung cancer (EKVX, HOP-92, and NCI-H522), colon cancer (HCT-116, HOP-92), melanoma (LOX IMVI), and ovarian cancer (OVCAR-4) cell lines. One brominated PQ analog (BrPQ5) was selected for a full panel five-dose in vitro assay by the NCI’s Development Therapeutic Program (DTP) division to determine GI50, TGI, and LC50parameters. The brominated PQ analog (BrPQ5) displayed remarkable activity against most tested cell lines, with GI50values ranging from 1.55 to 4.41 µM. The designed molecules (BrPQ analogs) obeyed drug-likeness rules, displayed a favorable predictive Absorption, Distribution, Metabolism, and Excretion (ADME) profile, and an in silico simulation predicted a possibleBrPQ5interaction with proteasome catalytic subunits. Furthermore, the in vitro cytotoxic activity ofBrPQ5was assessed, and IC50values for U-251 glioma, MCF-7 and MDA-MB-231 breast cancers, DU145 prostate cancer, HCT-116 colon cancer, and VHF93 fibroblast cell lines were evaluated using an MTT assay. MCF-7 was the most affected cell line, and the effects ofBrPQ5on cell proliferation, cell cycle, oxidative stress, apoptosis/necrosis induction, and proteasome activity were further investigated in MCF-7 cells. The in vitro assay results showed thatBrPQ5caused cytotoxicity in MCF-7 breast cancer cells via cell cycle arrest and oxidative stress induction. However,BrPQ5did not inhibit the catalytic activity of the proteasome. These results provide valuable insights for further discovery of novel antiproliferative agents.Publication Open Access Analysis of quinolinequinone analogs with promising cytotoxic activity against breast cancer(2023-01-01) YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE; YILMAZ GÖLER A. M., Tarbin Jannuzzi A., Biswas A., Mondal S., Basavanakatti V. N., Jayaprakash Venkatesan R., YILDIRIM H., Yıldız M., ÇELİK ONAR H., BAYRAK N., et al.It is quite challenging to find out bioactive molecules in the vast chemical universe. Quinone moiety is a unique structure with a variety of biological properties, particularly in the treatment of cancer. In an effort to develop potent and secure antiproliferative lead compounds, five quinolinequinones (AQQ1-5) described previously have been selected and submitted to the National Cancer Institute (NCI) of Bethesda to envisage their antiproliferative profile based on the NCI Developmental Therapeutics Program. According to the preliminary in vitro single-dose anticancer screening, four of five quinolinequinones (AQQ2-5) were selected for five-dose screening and they displayed promising antiproliferative effects against several cancer types. All AQQs showed a excellent anticancer profile with low micromolar GI50 and TGI values against all leukemia cell lines, some non-small cell lung and ovarian cancer, most colon, melanoma, and renal cancer, and in addition to some breast cancer cell lines. AQQ2-5 reduced the proliferation of all leukemia cell lines at a single dose and five additional doses, as well as some non-small cell lung and ovarian cancer, the majority of colon cancer, melanoma and renal cancer, and some breast cancer cell lines. This motivated us to use in vitro, in silico, and in vivo technologies to further investigate their mode of action. We investigated the in vitro cytotoxic activities of the most promising compounds, AQQ2 and AQQ3, in HCT-116 colon cancer, MCF7 and T-47D breast cancer, and DU-145 prostate cancer cell lines, and HaCaT human keratinocytes. Concomitantly, IC50 values of AQQ2 and AAQ3 against MCF7 and T-47D cell lines of breast cancer, DU-145 cell lines of prostate cancer, HCT-116 cell lines of colon cancer, and HaCaT human keratinocytes were determined. AQQ2 exhibited anticancer activity through the induction of apoptosis and caused alterations in the cell cycle. In silico pharmacokinetic studies of all analogs have been carried out against ATR, CHK1, WEE1, CDK1, and CDK2. In addition to this, in vitro ADME and in vivo pharmacokinetic profiling for the most effective AAQ (AAQ2) have been studied.Publication Open Access Higher proteotoxic stress rather than mitochondrial damage is involved in higher neurotoxicity of bortezomib compared to carfilzomib(ELSEVIER, 2020-05) YILMAZ GÖLER, AYŞE MİNE; Jannuzzi, Ayse Tarbin; Arslan, Sema; Yilmaz, Ayse Mine; Sari, Gulce; Beklen, Hande; Mendez, Lucia; Fedorova, Maria; Arga, Kazim Yalcin; Yilmaz, Betul Karademir; Alpertunga, BuketProteasome inhibitors have great success for their therapeutic potential against hematologic malignancies. First generation proteasome inhibitor bortezomib induced peripheral neuropathy is considered as a limiting factor in chemotherapy and its second-generation counterpart carfilzomib is associated with lower rates of neurotoxicity. The mitochondrial toxicity (mitotoxicity) hypothesis arises from studies with animal models of bortezomib induced peripheral neuropathy. However, molecular mechanisms are not fully elucidated and the role of mitotoxicity in bortezomib and carfilzomib induced neurotoxicity has not been investigated comparatively. Herein, we characterized the neurotoxic effects of bortezomib and carfilzomib at the molecular level in human neuronal cells using LC-MS/MS analysis, flow cytometry, RT-qPCR, confocal microscopy and western blotting. We showed that bortezomib and carfilzomib affected the human neuronal proteome differently, and bortezomib caused higher proteotoxic stress via protein oxidation, protein K48-ubiquitination, heat shock protein expression up-regulation and reduction of mitochondria membrane potential. Bortezomib and carfilzomib did not affect the gene expression levels related to mitochondrial dynamics (optic atrophy 1; OPA1, mitofusin 1; MFN1, mitofusin 2; MFN2, fission 1; FIS1, dynamin-related protein 1; DRP1) and overall mitophagy rate whereas, PINK1/Parkin mediated mitophagy gene expressions were altered with both drugs. Bortezomib and carfilzomib caused downregulation of the contents of mitochondrial oxidative phosphorylation complexes, voltage-dependent anion channel 1 (VDAC1) and uncoupling protein 2 (UCP2) similarly. Our findings suggest that, both drugs induce mitotoxicity besides proteotoxic stress in human neuronal cells and the higher incidence of neurotoxicity with bortezomib than carfilzomib is not directly related to mitochondrial pathways.