Person: İLKİ, ZEYNEP ARZU
Loading...
Email Address
Birth Date
Research Projects
Organizational Units
Job Title
Last Name
İLKİ
First Name
ZEYNEP ARZU
Name
52 results
Search Results
Now showing 1 - 10 of 52
Publication Metadata only Sağlıklı çocukların orafarenksinde kolonize olan bakteriyel patojenlerin antimikrobiyal duyarlılıkları(Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Yayınları, 2000-10-11) KARAHASAN, AYŞEGÜL; İLKİ, ZEYNEP ARZU; ÜLGER, NURVER; SÖYLEDİR, GÜNER; Karahasan A., İlki Z. A., Ülger N., Söyledir G.; Cengiz, A. Tevfik; Erdem, Birsel; Dolapçı, G. İştar; Tekeli, F. AlperPublication Open Access Healthcare-associated staphylococcus aureus infections in children in Turkey: A six-year retrospective, single-center study(2023-08-01) İLKİ, ZEYNEP ARZU; KEPENEKLİ KADAYİFCİ, EDA; Yakut N., Ergenç Z., Tuncay S. A., Bayraktar S., Sayın E., İlki Z. A., Kepenekli Kadayifci E.Objective: To describe clinical and epidemiological characteristics, antimicrobial susceptibility and mortality-associated factors of healthcare-associated infections (HCAIs) caused by Staphylococcus (S.) aureus in children. Methods: We conducted a retrospective, single-centre study of pediatric HCAIs caused by S. aureus from a tertiary care hospital in Turkey between February 2014 and December 2019. The clinical and epidemiological characteristics and antimicrobial susceptibility of the methicillin-susceptible and methicillin-resistant S. aureus (MSSA and MRSA) isolates was evaluated. Results: A total of 310 pediatric patients were examined. Overall, 225 (72.6%) isolates were MSSA and 85 (27.4%) were MRSA. All S. aureus isolates were susceptible to teicoplanin, vancomycin, linezolid, tigecycline, mupirocin, and daptomycin. Penicillin resistance rates were high (89.0%), while fosfomycin, gentamicin, and clindamycin resistance rates were low (1.3%, 1.0%, and 2.3%, respectively). Except susceptibility to fosfomycin, which was significantly lower in 2014 compared to 2018 and 2019, no significant difference was found in the antimicrobial susceptibility of S. aureus isolates between the years. Baseline characteristics and mortality rate were similar comparing MRSA and MSSA causing HCAIs. The mortality rate of HCAIs caused by S. aureus was 6.5% (20 patients). Malignancy was an independent risk factor associated with mortality in the multivariate analysis (OR 5.446, 95% CI 1.573- 18.849). Conclusions: Our findings demonstrate that MSSA remained the most causative agent of HCAIs caused by S. aureus. The mortality rate was 6.5%, the antibiotic resistance rate was quite high for penicillin and diagnosis of malignancy was the main risk factor for increasing mortality in children. These findings could help improve the management of HCAIs caused by S. aureus in children.Publication Metadata only Evaluation of the Diagnostic Value of Cell Population Data in Sepsis in Comparison to Localized Infection, Chronic Inflammation, and Noninfectious Inflammation Cases.(2022-09-22) DİRESKENELİ, RAFİ HANER; KAYA, ÖZLEM; GÜL, FETHİ; İNANÇ, GÜZİDE NEVSUN; İLKİ, ZEYNEP ARZU; ŞİRİKÇİ, ÖNDER; HAKLAR, GONCAGÜL; Çevlik T., Kaya Ö., Gül F., Turkal R., İnanç N., Direskeneli H., İlki A., Şirikçi Ö., Haklar G., Cinel İ.Introduction Sepsis, defined as an increase of 2 points or more in the sequential organ failure assessment score, is a life-threatening organ dysfunction caused by the dysregulated host response to infection. Volume-conductivity-scatter (VCS) parameters of cell counters which are known as cell population data (CPD) have been suggested to be beneficial in diagnosing sepsis. We aimed to evaluate the diagnostic value of CPD parameters in sepsis in comparison to nonsystemic infection cases (NSI) and non-infectious acute and chronic inflammatory conditions. Materials and Methods We prospectively included four groups of patients” data: sepsis (n = 66), localized infection (pneumonia, n = 59), chronic inflammation (rheumatoid arthritis, n = 92) and noninfectious inflammation (coronary artery bypass graft operation, n = 56) groups, according to their clinical status and laboratory results. Samples for cell counting and serum markers were collected on the same day of culture collection. VCS parameters were measured by Unicel DxH800 Coulter Cellular Analyzer (Beckman Coulter, USA). Results Mean neutrophil volume (MN-V-NE), was highest in the sepsis group [155(149-168)] compared to the localized infection [148(140-158)], chronic inflammation [144.5(142-149)] and noninfectious inflammation [149(145.2-153.7)] (P = 0.001, P < 0.001, P < 0.001, respectively). Neutrophil volume SD (SD-V-NE) was higher in the sepsis [21(18.8-23.7)], significantly differentiating sepsis from other groups. The area under curves of procalcitonin and hs-C-reactive protein were 0.846 and 0.837, respectively, in the receiver-operating characteristic curves (ROC) . CPD combinations, (SD-V NE + SD-V LY + SD-V MO), (SD-V NE + SD-V MO), and (MN-V NE + SD-V NE + SD-C LY + SD-V MO) had greater AUC values than procalcitonin’s. Conclusion VCS parameters might be promising for differentiating sepsis and non-sepsis cases. Additionally, obtaining these data routinely makes their prospects promising without any additional cost and time.Publication Metadata only Escherichia coli, klebsiella pneumoniae ve Staphylococcus aureus izolatlarında iki yıllık kümülatif antibiyogram sonuçları(2022-11-16) GÜNEŞER, DENİZ; HASDEMİR GÖKBOĞA, MÜNEVVER UFUK; ÜLGER, NURVER; KÜÇÜKSU, UĞUR; İLKİ, ZEYNEP ARZU; Güneşer D., Hasdemir Gökboğa M. U., Ülger N., İlki Z. A., Küçüksu U., Ergan B., Akıllı F. M., Sarı ., Demirkol Ö., Demircan S.Giriş ve Amaç: Kümülatif antibiyotik duyarlılık test verileri, bir hastanede belirli bir zaman periyodunda enfeksiyon etkeni bakterilerin tür bazında duyarlılık sonuçlarının incelenmesine imkan sağlayarak o kurumda doğru ampirik tedavi yaklaşımlarının yönlendirilmesinde kilit rol oynamaktadır. Biz burada hastanemizde iki yıllık dönemde Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae ve Staphylococcus aureus izolatlarının kümülatif antibiyotik duyarlılık test verilerinin analizini sunuyoruz. Gereç ve Yöntem: Ocak 2020 – Aralık 2021’i kapsayan iki yıllık dönemde hastanemizde erişkin hastalarda enfeksiyon etkeni olduğu belirlenen E. coli, K. pneumoniae, S. aureus izolatlarının yıllık bazda kümülatif antibiyotik test sonuçlarını değerlendirdik. Bu değerlendirmeyi KLİMUD Antibiyotik Duyarlılıklarının Saptanması ve İzlenmesi Çalışma Grubu’nun “Antibiyotik Duyarlılık Verilerinin Analizi Ve Sunumu Rehberi” önerileri doğrultusunda yaptık. Değerlendirmeye, TMC Antibiyotik Duyarlılık Testlerinin Standardizasyonu Çalışma Grubu’nun bakteri türü bazında önerdiği antibiyotikler alındı. Escherichia coli ve K. pneumoniae için değerlendirme idrar ve idrar dışı örnekler (kan, solunum, BOS) bazında, S. aureus için metisilin duyarlılığı bazında yapıldı. Laboratuvarımızda rutin olarak idrar Escherichia coli izolatlarında fosfomisin duyarlılığı disk difüzyon ile, S. aureus’ta metisilin duyarlılığı sefoksitin disk difüzyon ile ve indüklenebilir klindamisin direnci D-test ile belirlenmektedir. İzolatların diğer antibiyotiklere duyarlılıkları ise rutin olarak VITEK2 Compact (bioMérieux, Fransa) otomatize sistemi ile saptanmaktadır. Antibiyotik duyarlılık testlerinin kalite kontrolü laboratuvarımızda rutin olarak haftalık bazda çalışılmaktadır Bulgular ve Sonuç: İki yıllık dönemde, toplam olarak 2958 E. coli, 1690 K. pneumoniae ve 1087 S. aureus kümülatif antibiyograma dahil edildi. Yıllık bazda izolat sayıları Grafik 1, Grafik 2 ve Grafik 3’te gösterilmektedir. Escherichia coli’nin her iki yılda karbapenem, aminoglikozit, fosfomisin ve nitrofurantoin duyarlılıkları %80’in üzerinde saptandı (Grafik 1). Klebsiella pneumoniae’da, idrar dışı izolatların test edilen antibiyotiklere duyarlılıkları idrar izolatlarına kıyasla belirgin olarak düşük saptandı (Grafik 2). 2020 ile 2021 yılları arasında, birkaç antibiyotik dışında (idrar dışı izolatların kinolon ve trimetoprim/sulfametoksazol duyarlılığı) K. pneumoniae izolatlarının duyarlılık yüzdelerinde belirgin bir fark gözlenmedi. Metisilin dirençli S. aureus’ta (MRSA) makrolid, linkozamid ve tetrasiklin duyarlılıkları, metisiline duyarlı S. aureus (MSSA) izolatlarından belirgin olarak düşük bulundu (Grafik 3). Trimetoprim/ sulfametoksazol ve gentamisin duyarlılıkları açısından, MRSA ve MSSA izolatları açısından belirgin bir fark saptanmadı. Beklenildiği üzere, glikopeptit direnci hiçbir izolatta saptanmadı. Sadece bir izolatta saptanan linezolid direnci doğrulandı. Pandemi döneminPublication Open Access Atypical Cell'' Parameter in Automated Urine Analysis for the Diagnosis of Bladder Cancer: A Retrospective Pilot Study(GALENOS YAYINCILIK, 2020-04-01) FİLİNTE, DENİZ; Tinay, Ilker; Sahin, Bahadir; Saracoglu, Sertac; Yanilmaz, Ozgur; Aksu, Mehmet Burak; Ayas, Ramazan; Filinte, Deniz; Cam, Haydar Kamil; Ilki, ArzuObjective: To evaluate the application of an automated urine analyzer (AUA) for the diagnosis of bladder cancer (BC) Materials and Methods: A retrospective data analysis of 2365 urine specimens from the department of urology has been performed and matched with those patients, who have undergone cystoscopic evaluation or surgical treatment for different urological pathologies during 2018. After matching, clinical records of the patients has been further evaluated in order to select patients with recent or previous BC diagnosis. To assess the diagnostic efficacy of AUA, patients were divided into five groups according to the patient history of BC and healthy controls. Results: A total of 106 patients are included in this study and the majority (69.8%) of the patients are follow-up patients with previous diagnosis and treatment of non-muscle invasive BC (NMIBC). For patients with low-risk NMIBC (n=27), the sensitivity and specificity were calculated as 75% and 100%. For patients with high-risk NMIBC (n=47), who were previously treated with intravesical BCG, the sensitivity and specificity were calculated as 54.5% and 83.3%. All patients in radical cystectomy group (n=7) with muscle invasive BC had positive urine analyses results for atypical cells. And none of the patients in the control group (n=8) had positive AUA results and cystoscopic evaluation also did not show any bladder mass suspicious for BC. Conclusion: The results of this retrospective pilot study showed acceptable sensitivity and specificity rates of the fluorescence flow cytometry based AUA and the results of the low-risk group are especially valuable regarding its potential use to decide on performing a follow-up cystoscopy or not. A prospective study is currently on progress to validate the findings of the current study.Publication Open Access Performance of Sysmex UF-5000 for candiduria screening(2022-12-01) İLKİ, ZEYNEP ARZU; Yanılmaz Ö., Akşit İlki A.In this study, we tested the performance of the Sysmex UF-5000 system to detect yeast-like cell (YLC) counting to screen for candiduria. Urine samples were screened for leukocyte and yeast amount by flow cytometry and results were compared with fungal culture results. A total of 56,749 urine samples were enrolled in this study. Urine culture and urinalysis of YLC data were used to evaluate the performance of YLC in diagnosing candiduria. Different cut-off values (YLC. 5, 10, 20, 50, 100/µl) were evaluated. Youden index was used to determine the ideal cut-off value, and the highest was 0.95 with 5 YLC/µl. When the cut-off value for YLC is 5 cells/µl, 95.15% of the samples were “negative” with flow cytometry and culture (NPV:100%). In conclusion, detection of YLC by flow cytometer (Sysmex UF-5000) can be a rapid alternative method to exclude candiduria prior to urine culture.Publication Metadata only Hastanemizden Bir Non Toksijenik {Vibrio cholerae} Bakteriyemi Olgusu(2022-11-16) İLKİ, ZEYNEP ARZU; ODABAŞI, ZEKAVER; ÜLGER, NURVER; Ergan B., Kökkaya Y. E., Levent B., Çağlayık D. Y., İlki Z. A., Odabaşı Z., Ülger N.Publication Metadata only Asymtomatic carriage of Neisseria meningitidis and Neisseria lactamica in relation to Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae colonization in healthy children: apropos of 1400 children sampled(2001) KARAHASAN, AYŞEGÜL; Bakir, M.; Yagci, A.; Ulger, N.; Akbenlioglu, C.; Ilki, A.; Soyletir, G.Meningococcal disease is one of the most important causes of morbidity and mortality among children in many parts of the world. Main reservoir of carriage and site of meningococcal dissemination appears to be the upper respiratory tract. Colonization of Neisseria meningitidis and lactamica and factors affecting this carriage were determined in a group of healthy children aged 0-10 years. Meningococcus and N. lactamica carriage were detected in 17 (1.23%) and 245 (17.7%) of 1382 subjects, respectively. Number (%) of serogroups for meningococci was 1 (6), 5 (29), 0 (0), 1 (6), 1 (6), and 9 (53) for A, B, C, D, W135, and Y, respectively. Having more than three household members, elementary school attendance, pharyngeal carriage of Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae were associated with carriage of meningococci, whereas age less than 24-month was associated with carriage of N. lactamica. There was a reverse carriage rate between N. meningitidis and N. lactamica by age which may suggest a possible protective role of N. lactamica against meningococcal colonization among pre-school children.Publication Metadata only The role of human bocavirus on respiratory tract infections in children(2023-05-08) İLKİ, ZEYNEP ARZU; ÜLGER, NURVER; KEPENEKLİ KADAYİFCİ, EDA; Aslan Tuncay S., Ergan B., Ergenç Z., Yılmaz S., Parlak B., Canizci Erdem P., Dizi Işık A., İlki Z. A., Ülger N., Kepenekli Kadayifci E.Publication Metadata only Çoklu ilaca dirençli acinetobacter baumannii izolatlarında kolistin duyarlılığının farklı yöntemlerle saptanması, Mcr1-5 gen varlığının PZR yöntemi ile araştırılması(2023-11-02) İLKİ, ZEYNEP ARZU; Akıllı F. M., İlki Z. A.G"r"ş ve Amaç: Son yıllarda tüm dünyada dArençlA mAkroorganAzmaların yol açtığı enfeksAyonların sayısında artış göze çarpmaktadır. Dünya Sağlık Örgütü 2023 yılı antAmAkrobAyal dArenç küresel sürveyans raporunda, çoklu Alaca dArençlA A. baumannAA kökenlerAnAn büyük çoğunluğunun yoğun bakımda yatan hastalardan Azole edAldAğAnA ve ölüm oranının %50’den fazla olduğunu bAldArmAştAr. Çalışmamızda çoklu Alaca dArençlA (ÇİD) AcAnetobacter baumannAA Azolatlarının kolAstAn duyarlılıklarını altın standart sıvı mAkrodAlüsyon Ale belArlemeyA, tAcarA MİCRONAUT-MİK-StrAp (MerlAn, Almanya) yöntemAnAn performansını ölçmeyA ve dArençten sorumlu genotApAk mekanAzmaları belArlemeyA amaçladık. Gereç ve Yöntem: Çalışmaya Marmara ÜnAversAtesA PendAk EğAtAm ve Araştırma HastanesA KlAnAk MAkrobAyolojA laboratuvarında Aralık 2020-Aralık2022 yılları arasında yatan hastalara aAt çeşAtlA klAnAk örneklerden Azole edAlen 194 ÇİD’lA A. baumannAA Azolatı dahAl edAlmAştAr. İzolatlar matrAks Ale desteklenmAş lazer desorpsAyon AyonAzasyon uçuş zamanı kütle spektrometresA (MALDI-TOF MS) yöntemA Ale tanımlandı. KolAstAn duyarlılığı sıvı mAkrodAlüsyon (SMD) ve tAcarA MİCRONAUT-MİK-StrAp yöntemAyle çalışılmıştır. TAcarA yöntemAn MİK’lerA standart sıvı mAkrodAlüsyon sonuçlarına göre değerlendArAlmAştAr. KolAstAn dArencA saptanan Azolatlarda dArençten sorumlu olası dArenç genlerA mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 ve mcr-5 multApleks PZR yöntemlerAyle araştırılmıştır. Bulgular ve Sonuç: İzolatların %56,1’A solunum örneklerAnden (BAL (n:4)%2,06, DTA-ETA (n:88) %45,3’ü balgam (n:15) %7,7’sA DFS (n:2)%1,03), %28,3’ü (n:55) kandan, %0,5’A(n:1) kateterden %1,5’u (n:3) plevra sıvısından, %1,5(n:3) BOS ve %4,1’A(n:8) Adrardan Azole edAlmAştAr. Altın standart yöntem sıvı mAkrodAlüsyon Ale kolAstAn duyarlılığı çalışılan 194 A. baumannAA‘nAn 23’ü (%11.8) dArençlA Aken, 171 (%88.2) Azolat Ase duyarlı bulunmuştur. İzolatlarda MİK50 1 mg/L Aken, MİK90 2 mg/L’dAr. KolAstAn duyarlılığı açısından MİCRONAUT-MİK-StrAp sonuçları referans yöntem Ale karşılaştırıldığında, kategorAk uyumu %98,9, temel uyum Ase %96,3 olarak saptanmıştır. MİK dağılımları değerlendArAldAğAnde çok büyük hata saptanmaz Aken, büyük hata %1,03 bulunmuştur. DArençlA tüm kökenler Ale eş sayıda ve randomAze seçAlen kolAstAn duyarlı toplam 46 Azolatta mcr1 mcr-2, mcr-3, mcr-4 ve mcr-5 genlerA saptanmamıştır. İzolatların SMD ve MICRONAUT MİK-StrAp testA Ale çalışılan kolAstAn duyarlılık dağılımı tablo 1’de gösterAlmAştAr. Sonuç olarak kolAstAn dArencA ÇİD A.baumannAA’lerde küresel bAr sorun olmaya devam ederken, MİCRONAUT-MİK-StrAp testA kolAstAn duyarlılığını saptama da alternatAf güvenAlAr bAr yöntem olarak karşımıza çıkmaktadır. Çalışmamızda hAçbAr Azolatta kolAstAn dArencAyle AlAşkAlA mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4, mcr-5 genlerAnAn saptanmamış olması muhtemel sorumlu başka mekanAzmaların olabAleceğAnA düşündürmüştür.