Publication:
Antimikrobiyel Ajanların Etkisini Anlamak Için Sistem Biyolojisi Yaklasımı Ile Birlestirilmis OMIK Verilerin Analizi

Simple item page
dc.contributorSarıyar Akbulut, Berna
dc.contributor.authorsEzgi AKAN;Berna Sarıyar AKBULUT;Eldin KURPEJOVİC;İpek KARACAN;Nilay BÜDEYRİ GÖKGÖZ;Fatma Gizem AVCI;Dilek KAZAN;Deniz YILMAZ;Alpagu SAYAR;Dilara AYYILDIZ
dc.contributor.department Mühendislik Fakültesi
dc.date2017
dc.date.accessioned2022-04-05T23:01:35Z
dc.date.available2022-04-05T23:01:35Z
dc.date.issued2017-01-08
dc.description.abstractBu proje aporfin sınıfına ait farklı alkaloitlerin antibakteriyel mekanizmalarının proteom ve lipidom çalışmaları ile anlaşılmasını ve yeni ilaç adayları olarak değerlendirilebilmesini hedeflemektedir. Bu hedef doğrultusunda incelenmek üzere (-)-römerin, boldin ve bulbokapnin olmak üzere üç farklı alkaloit belirlenmiş ve model mikroorganizma olarak da Escherichia coli ve Bacillus subtilis seçilmiştir. Bu üç alkaloidin seçilmesinin en önemli nedeni hepsinin aporfine sııfına ait olmaları ve yapısal olarak birbirlerine yüksek benzerlik göstermeleridir. Alkaloitlerin olası etkilerinin anlaşılması doğrultusunda öncelikle çalışma konsantrasyonunun seçilebilmesi için büyüme eğrileri çıkarılmış ve canlı hücre sayıları belirlenmiştir. Ayrıca B. subtilis stres koşullarında spor oluşturduğu için, çalışılan konsantrasyonda bu bakterinin spor oluşturmamış olmamasına dikkat edilmiştir. 100 μg mL-1 (-)-römerin varlığında E. coli hücrelerinde genel olarak hücre içi karbonhidrat varlığını kısıtlanmakta ve hücre porinleri azalmaktadır. Ozmotik denge ile ilgili ciddi bir değişiklik olmamıştır. 75 μg mL-1 (-)-römerin varlığında B. subtilis hücrelerinde ise yine hücre içi karbon akışı azalırken stres proteinlerinde önemli bir artış kaydedilmiştir. Ayrıca her iki bakteri için de çoklu ilaç direnç pompalarının önemi gözardı edilmemelidir. Bu iki model bakteride (-)- römerin varlığındaki lipidom değişikliklerini bakıldığında ise, lipit dağılımlarında önemlifarklılaşmalar kaydedilmiştir. (-)-Römerin varlığında hücre zarındaki taşınım proteinlerindeki farklılaşma da lipit dağılımındaki farklılaşma ile uyumludur. Diğer taraftan boldine ve bulbokapninin yüksek konsantrasyonlarında bile E. coli ve B. subtilis hücrelerinde belirgin bir aktivite gözlemlenmemiştir. Bu doğrultuda (-)-römerinin yeni bir antibakteriyel ilaç adayı olarak değerlendirilmesi önerilebilir.
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11424/263290
dc.language.isotur
dc.relation.urihttps://app.trdizin.gov.tr/proje/TVRjeU1qVTE/antimikrobiyel-ajanlarin-etkisini-anlamak-icin-sistem-biyolojisi-yaklasimi-ile-birlestirilmis-omik-verilerin-analizi
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectMühendislik, Biyotıp
dc.titleAntimikrobiyel Ajanların Etkisini Anlamak Için Sistem Biyolojisi Yaklasımı Ile Birlestirilmis OMIK Verilerin Analizi
dc.typearticle
dc.type.subproject
dspace.entity.typePublication
local.import.idVRjeU1qVTE
local.import.packageSS38
local.import.sourceTRDizin
local.project.groupTÜBİTAK MAG Proje
local.project.number113M052
local.project.pages1

Files

Original bundle
Now showing 1 - 1 of 1
Thumbnail Image
Name:
antimikrobiyel-ajanlarin-etkisini-anlamak-icin-sistem-biyolojisi-yaklasimi-ile-birlestirilmis-omik-verilerin-analizi.pdf
Size:
2.99 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download

Collections

Tübitak Proje Çıktıları